UBE2K |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1YLA, 2O25, 3E46, 3F92, 3K9O, 3K9P, 5DFL | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | UBE2K, E2-25K, HIP2, HYPG, LIG, UBC1, ubiquitin conjugating enzyme E2 K |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602846 MGI: 1858216 HomoloGene: 3903 GeneCards: UBE2K |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity • nucleotide binding • ubiquitin-ubiquitin ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • ubiquitin protein ligase binding • ubiquitin conjugating enzyme activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • filopodium tip • клітинне ядро • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • protein K48-linked ubiquitination • positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress • free ubiquitin chain polymerization • positive regulation of peptidyl-threonine phosphorylation • ubiquitin-dependent protein catabolic process • cellular response to interferon-beta • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_005339 NM_001111112 NM_001111113 NM_001312646 NM_001312647
| NM_001312648 NM_032733 |
| | NM_016786 NM_001310618 NM_001310619 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001104582 NP_001104583 NP_001299575 NP_001299576 NP_001299577
| NP_005330 |
| | NP_001297547 NP_001297548 NP_058066 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 4: 39.7 – 39.78 Mb | Хр. 5: 65.69 – 65.76 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
UBE2K (англ. Ubiquitin conjugating enzyme E2 K) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 200 амінокислот, а молекулярна маса — 22 407[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MANIAVQRIK | | REFKEVLKSE | | ETSKNQIKVD | | LVDENFTELR | | GEIAGPPDTP |
YEGGRYQLEI | | KIPETYPFNP | | PKVRFITKIW | | HPNISSVTGA | | ICLDILKDQW |
AAAMTLRTVL | | LSLQALLAAA | | EPDDPQDAVV | | ANQYKQNPEM | | FKQTARLWAH |
VYAGAPVSSP | | EYTKKIENLC | | AMGFDRNAVI | | VALSSKSWDV | | ETATELLLSN |
|
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Flierman D., Coleman C.S., Pickart C.M., Rapoport T.A., Chau V. (2006). E2-25K mediates US11-triggered retro-translocation of MHC class I heavy chains in a permeabilized cell system. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 11589—11594. PMID 16868077 DOI:10.1073/pnas.0605215103
- Christensen D.E., Brzovic P.S., Klevit R.E. (2007). E2-BRCA1 RING interactions dictate synthesis of mono- or specific polyubiquitin chain linkages. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 941—948. PMID 17873885 DOI:10.1038/nsmb1295
- David Y., Ziv T., Admon A., Navon A. (2010). The E2 ubiquitin-conjugating enzymes direct polyubiquitination to preferred lysines. J. Biol. Chem. 285: 8595—8604. PMID 20061386 DOI:10.1074/jbc.M109.089003
- Oh K.J., Kalinina A., Bagchi S. (2010). Destabilization of Rb by human papillomavirus E7 is cell cycle dependent: E2-25K is involved in the proteolysis. Virology. 396: 118—124. PMID 19906396 DOI:10.1016/j.virol.2009.10.018
- Wenzel D.M., Lissounov A., Brzovic P.S., Klevit R.E. (2011). UBCH7 reactivity profile reveals parkin and HHARI to be RING/HECT hybrids. Nature. 474: 105—108. PMID 21532592 DOI:10.1038/nature09966
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4914 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P61086 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |