UBR5

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1I2T, 2QHO, 3PT3

Ідентифікатори

Символи

UBR5, DD5, EDD, EDD1, HYD, ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5

Зовнішні ІД

OMIM: 608413 MGI: 1918040 HomoloGene: 9295 GeneCards: UBR5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • ubiquitin-ubiquitin ligase activity • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • мембрана • гіалоплазма • perinuclear region of cytoplasm • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• negative regulation of double-strand break repair • negative regulation of histone H2A K63-linked ubiquitination • protein polyubiquitination • progesterone receptor signaling pathway • cellular response to DNA damage stimulus • ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • Убіквітин-залежний протеоліз • проліферація • GO:0100026 Репарація ДНК • GO:1901313 positive regulation of gene expression • GO:0022415 viral process • protein K48-linked ubiquitination • positive regulation of protein import into nucleus
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51366


70790

Ensembl


ENSG00000104517


ENSMUSG00000037487

UniProt


O95071


Q80TP3

RefSeq (мРНК)


NM_001282873 NM_015902


NM_001081359 NM_001112721 NM_027553

RefSeq (білок)


NP_001269802 NP_056986


NP_001074828 NP_001106192

Локус (UCSC)

Хр. 8: 102.25 – 102.41 Mb

Хр. 15: 37.97 – 38.08 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

UBR5 (англ. Ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 799 амінокислот, а молекулярна маса — 309 352^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTSIHFVVHP	LPGTEDQLND	RLREVSEKLN	KYNLNSHPPL	NVLEQATIKQ
CVVGPNHAAF	LLEDGRVCRI	GFSVQPDRLE	LGKPDNNDGS	KLNSNSGAGR
TSRPGRTSDS	PWFLSGSETL	GRLAGNTLGS	RWSSGVGGSG	GGSSGRSSAG
ARDSRRQTRV	IRTGRDRGSG	LLGSQPQPVI	PASVIPEELI	SQAQVVLQGK
SRSVIIRELQ	RTNLDVNLAV	NNLLSRDDED	GDDGDDTASE	SYLPGEDLMS
LLDADIHSAH	PSVIIDADAM	FSEDISYFGY	PSFRRSSLSR	LGSSRVLLLP
LERDSELLRE	RESVLRLRER	RWLDGASFDN	ERGSTSKEGE	PNLDKKNTPV
QSPVSLGEDL	QWWPDKDGTK	FICIGALYSE	LLAVSSKGEL	YQWKWSESEP
YRNAQNPSLH	HPRATFLGLT	NEKIVLLSAN	SIRATVATEN	NKVATWVDET
LSSVASKLEH	TAQTYSELQG	ERIVSLHCCA	LYTCAQLENS	LYWWGVVPFS
QRKKMLEKAR	AKNKKPKSSA	GISSMPNITV	GTQVCLRNNP	LYHAGAVAFS
ISAGIPKVGV	LMESVWNMND	SCRFQLRSPE	SLKNMEKASK	TTEAKPESKQ
EPVKTEMGPP	PSPASTCSDA	SSIASSASMP	YKRRRSTPAP	KEEEKVNEEQ
WSLREVVFVE	DVKNVPVGKV	LKVDGAYVAV	KFPGTSSNTN	CQNSSGPDAD
PSSLLQDCRL	LRIDELQVVK	TGGTPKVPDC	FQRTPKKLCI	PEKTEILAVN
VDSKGVHAVL	KTGNWVRYCI	FDLATGKAEQ	ENNFPTSSIA	FLGQNERNVA
IFTAGQESPI	ILRDGNGTIY	PMAKDCMGGI	RDPDWLDLPP	ISSLGMGVHS
LINLPANSTI	KKKAAVIIMA	VEKQTLMQHI	LRCDYEACRQ	YLMNLEQAVV
LEQNLQMLQT	FISHRCDGNR	NILHACVSVC	FPTSNKETKE	EEEAERSERN
TFAERLSAVE	AIANAISVVS	SNGPGNRAGS	SSSRSLRLRE	MMRRSLRAAG
LGRHEAGASS	SDHQDPVSPP	IAPPSWVPDP	PAMDPDGDID	FILAPAVGSL
TTAATGTGQG	PSTSTIPGPS	TEPSVVESKD	RKANAHFILK	LLCDSVVLQP
YLRELLSAKD	ARGMTPFMSA	VSGRAYPAAI	TILETAQKIA	KAEISSSEKE
EDVFMGMVCP	SGTNPDDSPL	YVLCCNDTCS	FTWTGAEHIN	QDIFECRTCG
LLESLCCCTE	CARVCHKGHD	CKLKRTSPTA	YCDCWEKCKC	KTLIAGQKSA
RLDLLYRLLT	ATNLVTLPNS	RGEHLLLFLV	QTVARQTVEH	CQYRPPRIRE
DRNRKTASPE	DSDMPDHDLE	PPRFAQLALE	RVLQDWNALK	SMIMFGSQEN
KDPLSASSRI	GHLLPEEQVY	LNQQSGTIRL	DCFTHCLIVK	CTADILLLDT
LLGTLVKELQ	NKYTPGRREE	AIAVTMRFLR	SVARVFVILS	VEMASSKKKN
NFIPQPIGKC	KRVFQALLPY	AVEELCNVAE	SLIVPVRMGI	ARPTAPFTLA
STSIDAMQGS	EELFSVEPLP	PRPSSDQSSS	SSQSQSSYII	RNPQQRRISQ
SQPVRGRDEE	QDDIVSADVE	EVEVVEGVAG	EEDHHDEQEE	HGEENAEAEG
QHDEHDEDGS	DMELDLLAAA	ETESDSESNH	SNQDNASGRR	SVVTAATAGS
EAGASSVPAF	FSEDDSQSND	SSDSDSSSSQ	SDDIEQETFM	LDEPLERTTN
SSHANGAAQA	PRSMQWAVRN	TQHQRAASTA	PSSTSTPAAS	SAGLIYIDPS
NLRRSGTIST	SAAAAAAALE	ASNASSYLTS	ASSLARAYSI	VIRQISDLMG
LIPKYNHLVY	SQIPAAVKLT	YQDAVNLQNY	VEEKLIPTWN	WMVSIMDSTE
AQLRYGSALA	SAGDPGHPNH	PLHASQNSAR	RERMTAREEA	SLRTLEGRRR
ATLLSARQGM	MSARGDFLNY	ALSLMRSHND	EHSDVLPVLD	VCSLKHVAYV
FQALIYWIKA	MNQQTTLDTP	QLERKRTREL	LELGIDNEDS	EHENDDDTNQ
SATLNDKDDD	SLPAETGQNH	PFFRRSDSMT	FLGCIPPNPF	EVPLAEAIPL
ADQPHLLQPN	ARKEDLFGRP	SQGLYSSSAS	SGKCLMEVTV	DRNCLEVLPT
KMSYAANLKN	VMNMQNRQKK	EGEEQPVLPE	ETESSKPGPS	AHDLAAQLKS
SLLAEIGLTE	SEGPPLTSFR	PQCSFMGMVI	SHDMLLGRWR	LSLELFGRVF
MEDVGAEPGS	ILTELGGFEV	KESKFRREME	KLRNQQSRDL	SLEVDRDRDL
LIQQTMRQLN	NHFGRRCATT	PMAVHRVKVT	FKDEPGEGSG	VARSFYTAIA
QAFLSNEKLP	NLECIQNANK	GTHTSLMQRL	RNRGERDRER	EREREMRRSS
GLRAGSRRDR	DRDFRRQLSI	DTRPFRPASE	GNPSDDPEPL	PAHRQALGER
LYPRVQAMQP	AFASKITGML	LELSPAQLLL	LLASEDSLRA	RVDEAMELII
AHGRENGADS	ILDLGLVDSS	EKVQQENRKR	HGSSRSVVDM	DLDDTDDGDD
NAPLFYQPGK	RGFYTPRPGK	NTEARLNCFR	NIGRILGLCL	LQNELCPITL
NRHVIKVLLG	RKVNWHDFAF	FDPVMYESLR	QLILASQSSD	ADAVFSAMDL
AFAIDLCKEE	GGGQVELIPN	GVNIPVTPQN	VYEYVRKYAE	HRMLVVAEQP
LHAMRKGLLD	VLPKNSLEDL	TAEDFRLLVN	GCGEVNVQML	ISFTSFNDES
GENAEKLLQF	KRWFWSIVEK	MSMTERQDLV	YFWTSSPSLP	ASEEGFQPMP
SITIRPPDDQ	HLPTANTCIS	RLYVPLYSSK	QILKQKLLLA	IKTKNFGFV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Maddika S., Chen J. (2009). Protein kinase DYRK2 is a scaffold that facilitates assembly of an E3 ligase. Nat. Cell Biol. 11: 409—419. PMID 19287380 DOI:10.1038/ncb1848
Bethard J.R., Zheng H., Roberts L., Eblen S.T. (2011). Identification of phosphorylation sites on the E3 ubiquitin ligase UBR5/EDD. J. Proteomics. 75: 603—609. PMID 21924388 DOI:10.1016/j.jprot.2011.08.023
Deo R.C., Sonenberg N., Burley S.K. (2001). X-ray structure of the human hyperplastic discs protein: an ortholog of the C-terminal domain of poly(A)-binding protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 4414—4419. PMID 11287654 DOI:10.1073/pnas.071552198

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16806 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, O95071 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.