USP18 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 5CHT, 5CHV | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | USP18, ISG43, UBP43, ubiquitin specific peptidase 18, PTORCH2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607057 MGI: 1344364 HomoloGene: 8047 GeneCards: USP18 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • thiol-dependent deubiquitinase • ISG15-specific protease activity • cysteine-type endopeptidase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • protein deubiquitination • regulation of inflammatory response • regulation of protein stability |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 18.15 – 18.18 Mb | Хр. 6: 121.22 – 121.25 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
USP18 (англ. Ubiquitin specific peptidase 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 372 амінокислот, а молекулярна маса — 43 011[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSKAFGLLRQ | | ICQSILAESS | | QSPADLEEKK | | EEDSNMKREQ | | PRERPRAWDY |
PHGLVGLHNI | | GQTCCLNSLI | | QVFVMNVDFT | | RILKRITVPR | | GADEQRRSVP |
FQMLLLLEKM | | QDSRQKAVRP | | LELAYCLQKC | | NVPLFVQHDA | | AQLYLKLWNL |
IKDQITDVHL | | VERLQALYTI | | RVKDSLICVD | | CAMESSRNSS | | MLTLPLSLFD |
VDSKPLKTLE | | DALHCFFQPR | | ELSSKSKCFC | | ENCGKKTRGK | | QVLKLTHLPQ |
TLTIHLMRFS | | IRNSQTRKIC | | HSLYFPQSLD | | FSQILPMKRE | | SCDAEEQSGG |
QYELFAVIAH | | VGMADSGHYC | | VYIRNAVDGK | | WFCFNDSNIC | | LVSWEDIQCT |
YGNPNYHWQE | | TAYLLVYMKM | | EC |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як убіквітинування білків. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Malakhov M.P., Malakhova O.A., Kim K.I., Ritchie K.J., Zhang D.-E. (2002). UBP43 (USP18) specifically removes ISG15 from conjugated proteins. J. Biol. Chem. 277: 9976—9981. PMID 11788588 DOI:10.1074/jbc.M109078200
- Burkart C., Fan J.B., Zhang D.E. (2012). Two independent mechanisms promote expression of an N-terminal truncated USP18 isoform with higher DeISGylation activity in the nucleus. J. Biol. Chem. 287: 4883—4893. PMID 22170061 DOI:10.1074/jbc.M111.255570
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12616 (англ.) . Архів оригіналу за 15 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UMW8 (англ.) . Архів оригіналу за 18 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |