WWP1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1ND7, 5HPS, 5HPT

Ідентифікатори

Символи

WWP1, AIP5, Tiul1, hSDRP1, WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1

Зовнішні ІД

OMIM: 602307 MGI: 1861728 HomoloGene: 21385 GeneCards: WWP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity
Клітинна компонента	• ubiquitin ligase complex • гіалоплазма • клітинна мембрана • екзосома • мембрана • клітинне ядро • цитоплазма
Біологічний процес	• viral entry into host cell • central nervous system development • ion transmembrane transport • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0072468 сигнальна трансдукція • ubiquitin-dependent protein catabolic process • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein polyubiquitination • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11059


107568

Ensembl


ENSG00000123124


ENSMUSG00000041058

UniProt


Q9H0M0


Q8BZZ3

RefSeq (мРНК)


NM_007013


NM_001276292 NM_177327 NM_001355222

RefSeq (білок)


NP_008944


NP_001263221 NP_796301 NP_001342151

Локус (UCSC)

Хр. 8: 86.34 – 86.48 Mb

Хр. 4: 19.61 – 19.71 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

WWP1 (англ. WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 922 амінокислот, а молекулярна маса — 105 202^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATASPRSDT	SNNHSGRLQL	QVTVSSAKLK	RKKNWFGTAI	YTEVVVDGEI
TKTAKSSSSS	NPKWDEQLTV	NVTPQTTLEF	QVWSHRTLKA	DALLGKATID
LKQALLIHNR	KLERVKEQLK	LSLENKNGIA	QTGELTVVLD	GLVIEQENIT
NCSSSPTIEI	QENGDALHEN	GEPSARTTAR	LAVEGTNGID	NHVPTSTLVQ
NSCCSYVVNG	DNTPSSPSQV	AARPKNTPAP	KPLASEPADD	TVNGESSSFA
PTDNASVTGT	PVVSEENALS	PNCTSTTVED	PPVQEILTSS	ENNECIPSTS
AELESEARSI	LEPDTSNSRS	SSAFEAAKSR	QPDGCMDPVR	QQSGNANTET
LPSGWEQRKD	PHGRTYYVDH	NTRTTTWERP	QPLPPGWERR	VDDRRRVYYV
DHNTRTTTWQ	RPTMESVRNF	EQWQSQRNQL	QGAMQQFNQR	YLYSASMLAA
ENDPYGPLPP	GWEKRVDSTD	RVYFVNHNTK	TTQWEDPRTQ	GLQNEEPLPE
GWEIRYTREG	VRYFVDHNTR	TTTFKDPRNG	KSSVTKGGPQ	IAYERGFRWK
LAHFRYLCQS	NALPSHVKIN	VSRQTLFEDS	FQQIMALKPY	DLRRRLYVIF
RGEEGLDYGG	LAREWFFLLS	HEVLNPMYCL	FEYAGKNNYC	LQINPASTIN
PDHLSYFCFI	GRFIAMALFH	GKFIDTGFSL	PFYKRMLSKK	LTIKDLESID
TEFYNSLIWI	RDNNIEECGL	EMYFSVDMEI	LGKVTSHDLK	LGGSNILVTE
ENKDEYIGLM	TEWRFSRGVQ	EQTKAFLDGF	NEVVPLQWLQ	YFDEKELEVM
LCGMQEVDLA	DWQRNTVYRH	YTRNSKQIIW	FWQFVKETDN	EVRMRLLQFV
TGTCRLPLGG	FAELMGSNGP	QKFCIEKVGK	DTWLPRSHTC	FNRLDLPPYK
SYEQLKEKLL	FAIEETEGFG	QE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

Flasza M., Gorman P., Roylance R., Canfield A.E., Baron M. (2002). Alternative splicing determines the domain structure of WWP1, a Nedd4 family protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 290: 431—437. PMID 11779188 DOI:10.1006/bbrc.2001.6206
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Galinier R., Gout E., Lortat-Jacob H., Wood J., Chroboczek J. (2002). Adenovirus protein involved in virus internalization recruits ubiquitin-protein ligases. Biochemistry. 41: 14299—14305. PMID 12450395 DOI:10.1021/bi020125b
Mund T., Pelham H.R. (2009). Control of the activity of WW-HECT domain E3 ubiquitin ligases by NDFIP proteins. EMBO Rep. 10: 501—507. PMID 19343052 DOI:10.1038/embor.2009.30
Li Y., Zhou Z., Alimandi M., Chen C. (2009). WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 targets the full-length ErbB4 for ubiquitin-mediated degradation in breast cancer. Oncogene. 28: 2948—2958. PMID 19561640 DOI:10.1038/onc.2009.162

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17004 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9H0M0 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.