XCL2

Ідентифікатори

Символи

XCL2, SCM-1b, SCM1B, SCYC2, chemokine (C motif) ligand 2, X-C motif chemokine ligand 2

Зовнішні ІД

OMIM: 604828 MGI: 104593 HomoloGene: 130513 GeneCards: XCL2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytokine activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • CCR chemokine receptor binding • chemokine activity
Клітинна компонента	• extracellular region • міжклітинний простір
Біологічний процес	• monocyte chemotaxis • chemokine-mediated signaling pathway • cellular response to tumor necrosis factor • кровообіг • neutrophil chemotaxis • хемотаксис • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • cellular response to interleukin-1 • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • cellular response to interferon-gamma • lymphocyte chemotaxis • inflammatory response • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of signaling receptor activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • positive regulation of T cell chemotaxis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6846


16963

Ensembl


ENSG00000143185


ENSMUSG00000026573

UniProt


Q9UBD3


P47993

RefSeq (мРНК)


NM_003175


NM_008510

RefSeq (білок)


NP_003166


NP_032536

Локус (UCSC)

Хр. 1: 168.54 – 168.54 Mb

Хр. 1: 164.76 – 164.76 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

XCL2 (англ. X-C motif chemokine ligand 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 114 амінокислот, а молекулярна маса — 12 567^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRLLILALLG	ICSLTAYIVE	GVGSEVSHRR	TCVSLTTQRL	PVSRIKTYTI
TEGSLRAVIF	ITKRGLKVCA	DPQATWVRDV	VRSMDRKSNT	RNNMIQTKPT
GTQQSTNTAV	TLTG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у такому біологічному процесі як хемотаксис. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10646 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9UBD3 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.