XPO1

Наявні структури

Пошук ортологів: C9JV99 PDBe C9JV99 RCSB

Список кодів PDB
1W9C, 2L1L, 3GB8, 4BSM, 4BSN, 5DIS

Ідентифікатори

Символи

XPO1, CRM1, emb, exp1, exportin 1, CRM-1

Зовнішні ІД

OMIM: 602559 MGI: 2144013 HomoloGene: 2554 GeneCards: XPO1

Пов'язані генетичні захворювання

хронічний лімфолейкоз^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein domain specific binding • transporter activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore • nuclear export signal receptor activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • Тільце Кахаля • ядерна мембрана • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • nuclear envelope • нуклеоплазма • lamellae anulatae • клітинне ядро • кінетохор • ядерце • гіалоплазма • host cell • GO:0009327 protein-containing complex • Рибонуклеопротеїни • внутрішньоклітинний
Біологічний процес	• ribosomal small subunit export from nucleus • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of centrosome duplication • mRNA transport • regulation of mRNA stability • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • protein export from nucleus • GO:1903362 regulation of protein catabolic process • protein localization to nucleus • protein transport • ribosomal large subunit export from nucleus • intracellular protein transport • GO:0022415 viral process • sister chromatid cohesion • ribosomal subunit export from nucleus • regulation of protein export from nucleus • ribosome biogenesis • GO:0015915 транспорт • nucleocytoplasmic transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7514


103573

Ensembl


ENSG00000082898


ENSMUSG00000020290

UniProt


O14980


Q6P5F9

RefSeq (мРНК)


NM_003400


NM_001035226 NM_134014

RefSeq (білок)


NP_003391


NP_001030303 NP_598775

Локус (UCSC)

Хр. 2: 61.48 – 61.54 Mb

Хр. 11: 23.21 – 23.25 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

XPO1 (англ. Exportin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 071 амінокислот, а молекулярна маса — 123 386^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPAIMTMLAD	HAARQLLDFS	QKLDINLLDN	VVNCLYHGEG	AQQRMAQEVL
THLKEHPDAW	TRVDTILEFS	QNMNTKYYGL	QILENVIKTR	WKILPRNQCE
GIKKYVVGLI	IKTSSDPTCV	EKEKVYIGKL	NMILVQILKQ	EWPKHWPTFI
SDIVGASRTS	ESLCQNNMVI	LKLLSEEVFD	FSSGQITQVK	SKHLKDSMCN
EFSQIFQLCQ	FVMENSQNAP	LVHATLETLL	RFLNWIPLGY	IFETKLISTL
IYKFLNVPMF	RNVSLKCLTE	IAGVSVSQYE	EQFVTLFTLT	MMQLKQMLPL
NTNIRLAYSN	GKDDEQNFIQ	NLSLFLCTFL	KEHDQLIEKR	LNLRETLMEA
LHYMLLVSEV	EETEIFKICL	EYWNHLAAEL	YRESPFSTSA	SPLLSGSQHF
DVPPRRQLYL	PMLFKVRLLM	VSRMAKPEEV	LVVENDQGEV	VREFMKDTDS
INLYKNMRET	LVYLTHLDYV	DTERIMTEKL	HNQVNGTEWS	WKNLNTLCWA
IGSISGAMHE	EDEKRFLVTV	IKDLLGLCEQ	KRGKDNKAII	ASNIMYIVGQ
YPRFLRAHWK	FLKTVVNKLF	EFMHETHDGV	QDMACDTFIK	IAQKCRRHFV
QVQVGEVMPF	IDEILNNINT	IICDLQPQQV	HTFYEAVGYM	IGAQTDQTVQ
EHLIEKYMLL	PNQVWDSIIQ	QATKNVDILK	DPETVKQLGS	ILKTNVRACK
AVGHPFVIQL	GRIYLDMLNV	YKCLSENISA	AIQANGEMVT	KQPLIRSMRT
VKRETLKLIS	GWVSRSNDPQ	MVAENFVPPL	LDAVLIDYQR	NVPAAREPEV
LSTMAIIVNK	LGGHITAEIP	QIFDAVFECT	LNMINKDFEE	YPEHRTNFFL
LLQAVNSHCF	PAFLAIPPTQ	FKLVLDSIIW	AFKHTMRNVA	DTGLQILFTL
LQNVAQEEAA	AQSFYQTYFC	DILQHIFSVV	TDTSHTAGLT	MHASILAYMF
NLVEEGKIST	SLNPGNPVNN	QIFLQEYVAN	LLKSAFPHLQ	DAQVKLFVTG
LFSLNQDIPA	FKEHLRDFLV	QIKEFAGEDT	SDLFLEEREI	ALRQADEEKH
KRQMSVPGIF	NPHEIPEEMC	D

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fornerod M., Ohno M., Yoshida M., Mattaj I.W. (1997). CRM1 is an export receptor for leucine-rich nuclear export signals. Cell. 90: 1051—1060. PMID 9323133 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80371-2
Ossareh-Nazari B., Bachelerie F., Dargemont C. (1997). Evidence for a role of CRM1 in signal-mediated nuclear protein export. Science. 278: 141—144. PMID 9311922 DOI:10.1126/science.278.5335.141
Askjaer P., Jensen T.H., Nilsson J., Englmeier L., Kjems J. (1998). The specificity of the CRM1-Rev nuclear export signal interaction is mediated by RanGTP. J. Biol. Chem. 273: 33414—33422. PMID 9837918 DOI:10.1074/jbc.273.50.33414
Farjot G., Sergeant A., Mikaelian I. (1999). A new nucleoporin-like protein interacts with both HIV-1 Rev nuclear export signal and CRM-1. J. Biol. Chem. 274: 17309—17317. PMID 10358091 DOI:10.1074/jbc.274.24.17309
Lindsay M.E., Holaska J.M., Welch K., Paschal B.M., Macara I.G. (2001). Ran-binding protein 3 is a cofactor for Crm1-mediated nuclear protein export. J. Cell Biol. 153: 1391—1402. PMID 11425870 DOI:10.1083/jcb.153.7.1391

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з XPO1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12825 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O14980 (англ.) . Архів оригіналу за 30 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.