LIM domain Pinch蛋白的第四个LIM结构域,锌原子为灰色
鑑定 標誌 LIM Pfam PF00412(旧版) InterPro (英语 : InterPro ) IPR001781 PROSITE (英语 : PROSITE ) PDOC50178 SCOP (英语 : Structural Classification of Proteins ) 1ctl / SUPFAM CDD (英语 : Conserved Domain Database ) cd08368 現有可用的蛋白結構: Pfam 結構(旧版) / ECOD PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum (英语 : PDBsum ) 結構概要 PDB 1ctl A:11–67
LIM结构域 (英語:LIM domain )是一种蛋白质 结构域 ,由两个疏水 氨基酸残基 连接两个锌指 结构组成[ 1] ,其命名来自于最早发现这一结构域的三种蛋白(L in11, I sl-1 & M ec-3)的首字母[ 2] 。LIM结构域介导蛋白質交互作用 ,参与细胞骨架 组建,在器官发育和肿瘤发生 中有重要作用。
除了关键氨基酸如结合锌的半胱氨酸 和中心的疏水氨基酸外,LIM结构域的氨基酸序列高度可变,其通式如下:
[C]-[X]2–4 -[C]-[X]13–19 -[W]-[H]-[X]2–4 -[C]-[F]-[LVI]-[C]-[X]2–4 -[C]-[X]13–20 -C-[X]2–4 -[C]
LIM结构域的图示
参考文献 ^ Kadrmas JL, Beckerle MC. The LIM domain: from the cytoskeleton to the nucleus. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2004, 5 (11): 920–31. PMID 15520811 . doi:10.1038/nrm1499 . ^ Bach I. The LIM domain: regulation by association. Mech. Dev. 2000, 91 (1–2): 5–17. PMID 10704826 . doi:10.1016/S0925-4773(99)00314-7 . 3H (英语 : 3H domain ) ABM (英语 : ABM domain ) ACDC (英语 : ACDC domain ) ACT (英语 : ACT domain ) ADF-H (英语 : ADF-H domain ) ANTH (英语 : ANTH domain ) ARID (英语 : ARID domain ) BAR BEN (英语 : BEN domain ) BESS (英语 : BESS domain ) BIR (英语 : Inhibitor of apoptosis domain ) BMC (英语 : BMC domain ) BPS (英语 : BPS domain ) BTB/POZ (英语 : BTB/POZ domain ) BZIP (英语 : BZIP domain ) C1 (英语 : C1 domain ) C2 (英语 : C2 domain ) Cache (英语 : Cache domain ) CBS (英语 : CBS domain ) CGI-121 (英语 : Kinase binding protein CGI-121 ) CRM (英语 : CRM domain ) CUB (英语 : CUB domain ) CUT (英语 : CUT domain ) CVNH (英语 : CVNH domain ) 死亡 (英语 : Death fold ) CARD (英语 : CARD domain ) DD (英语 : Death domain ) DED (英语 : Death effector domain ) Pyrin (英语 : Pyrin domain ) DEP DHHC (英语 : DHHC domain ) DHR1 (英语 : DHR1 domain ) DHR2 (英语 : DHR2 domain ) DM (英语 : DM domain ) EcoEI_R_C (英语 : EcoEI R protein C-terminal domain ) EF1 (英语 : EF1 guanine nucleotide exchange domain ) ENTH FGGY (英语 : FGGY carbohydrate kinase family ) FYVE (英语 : FYVE domain ) HEAT (英语 : HEAT repeat ) Kringle (英语 : Kringle domain ) LIM LRR NACHT (英语 : NACHT domain ) PAS LOV (英语 : Light-oxygen-voltage-sensing domain ) PDZ (英语 : PDZ domain ) PH PX SH2 SH3 SUN TRIO (英语 : CRAL-TRIO domain ) WD40 (英语 : WD40 repeat ) X8 YTH (英语 : YTH protein domain ) 锌指