La saison 2016 du Championnat du Kirghizistan de football est la vingt-cinquième édition de la première division au Kirghizistan. Il n'y a que sept équipes engagées cette saison et la compétition prend la forme d'une poule unique où les formations s'affrontent à trois reprises.
C'est le FC Alay Och, tenant du titre, qui remporte à nouveau la compétition cette saison après avoir terminé en tête du classement final, avec deux points d'avance sur le Dordoi Bichkek et six sur l'Alga Bichkek. C'est le troisième titre de champion du Kirghizistan de l'histoire du club.
Le vainqueur du championnat se qualifie pour la phase de groupe de la Coupe de l'AFC 2017, la compétition inter-clubs de deuxième niveau en Asie tandis que le vainqueur de la Coupe nationale doit passer par le tour préliminaire.