IRF8

IRF8
Ідентифікатори
Символи IRF8, H-ICSBP, ICSBP, ICSBP1, IMD32A, IMD32B, IRF-8, interferon regulatory factor 8
Зовнішні ІД OMIM: 601565 MGI: 96395 HomoloGene: 1629 GeneCards: IRF8
Пов'язані генетичні захворювання
хронічний лімфолейкоз, Інфекція, яку спричинює вірус Епштейна — Барр[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

гіалоплазма
нуклеоплазма
клітинне ядро
цитоплазма

Біологічний процес

myeloid cell differentiation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
response to bacterium
positive regulation of interleukin-12 production
interferon-gamma-mediated signaling pathway
positive regulation of interferon-gamma production
positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter
transcription, DNA-templated
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
defense response to bacterium
type I interferon signaling pathway
GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь
Фагоцитоз
cellular response to lipopolysaccharide
defense response to protozoan
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
cellular response to interferon-gamma
автофагія
процес імунної системи

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3394
15900
Ensembl
ENSG00000140968
ENSMUSG00000041515
UniProt
Q02556
P23611
RefSeq (мРНК)
NM_002163
NM_001363907
NM_001363908
NM_001301811
NM_008320
RefSeq (білок)
NP_002154
NP_001350836
NP_001350837
NP_001288740
NP_032346
Локус (UCSC) Хр. 16: 85.9 – 85.92 Mb Хр. 8: 121.46 – 121.48 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

IRF8 (англ. Interferon regulatory factor 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 426 амінокислот, а молекулярна маса — 48 356[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MCDRNGGRRLRQWLIEQIDSSMYPGLIWENEEKSMFRIPWKHAGKQDYNQ
EVDASIFKAWAVFKGKFKEGDKAEPATWKTRLRCALNKSPDFEEVTDRSQ
LDISEPYKVYRIVPEEEQKCKLGVATAGCVNEVTEMECGRSEIDELIKEP
SVDDYMGMIKRSPSPPEACRSQLLPDWWAQQPSTGVPLVTGYTTYDAHHS
AFSQMVISFYYGGKLVGQATTTCPEGCRLSLSQPGLPGTKLYGPEGLELV
RFPPADAIPSERQRQVTRKLFGHLERGVLLHSSRQGVFVKRLCQGRVFCS
GNAVVCKGRPNKLERDEVVQVFDTSQFFRELQQFYNSQGRLPDGRVVLCF
GEEFPDMAPLRSKLILVQIEQLYVRQLAEEAGKSCGAGSVMQAPEEPPPD
QVFRMFPDICASHQRSFFRENQQITV

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з IRF8 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5358 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  5. UniProt, Q02556 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 16
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші