NIN |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | NIN, SCKL7, ninein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608684 MGI: 105108 HomoloGene: 40632 GeneCards: NIN |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Seckel syndrome 7[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
Viroporin 3a[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • calcium ion binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • kinase binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • центр організації мікротрубочок • spindle pole • ядерце • pericentriolar material • мікротрубочка • цитоскелет • mitotic spindle pole • microtubule minus-end • центросома • ciliary transition fiber • клітинне ядро • Центріоль • mitotic spindle • centriolar subdistal appendage • клітинна мембрана • аксон • дендрит (нейробіологія) • axonal growth cone • apical part of cell |
---|
Біологічний процес | • centrosome localization • centrosome-templated microtubule nucleation • microtubule anchoring at centrosome • GO:0034613 protein localization • centriole-centriole cohesion • corpus callosum morphogenesis • corticospinal tract morphogenesis • positive regulation of microtubule polymerization • collateral sprouting • positive regulation of axonogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_016350 NM_020921 NM_182944 NM_182945 NM_182946 |
| | NM_001081453 NM_001286079 NM_001286080 NM_008697 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_057434 NP_065972 NP_891989 NP_891991 |
| | NP_001074922 NP_001273008 NP_001273009 NP_032723 NP_001390761 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 14: 50.72 – 50.83 Mb | Хр. 12: 70.06 – 70.16 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NIN (англ. Ninein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 090 амінокислот, а молекулярна маса — 243 249[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDEVEQDQHE | | ARLKELFDSF | | DTTGTGSLGQ | | EELTDLCHML | | SLEEVAPVLQ |
QTLLQDNLLG | | RVHFDQFKEA | | LILILSRTLS | | NEEHFQEPDC | | SLEAQPKYVR |
GGKRYGRRSL | | PEFQESVEEF | | PEVTVIEPLD | | EEARPSHIPA | | GDCSEHWKTQ |
RSEEYEAEGQ | | LRFWNPDDLN | | ASQSGSSPPQ | | DWIEEKLQEV | | CEDLGITRDG |
HLNRKKLVSI | | CEQYGLQNVD | | GEMLEEVFHN | | LDPDGTMSVE | | DFFYGLFKNG |
KSLTPSASTP | | YRQLKRHLSM | | QSFDESGRRT | | TTSSAMTSTI | | GFRVFSCLDD |
GMGHASVERI | | LDTWQEEGIE | | NSQEILKALD | | FSLDGNINLT | | ELTLALENEL |
LVTKNSIHQA | | ALASFKAEIR | | HLLERVDQVV | | REKEKLRSDL | | DKAEKLKSLM |
ASEVDDHHAA | | IERRNEYNLR | | KLDEEYKERI | | AALKNELRKE | | REQILQQAGK |
QRLELEQEIE | | KAKTEENYIR | | DRLALSLKEN | | SRLENELLEN | | AEKLAEYENL |
TNKLQRNLEN | | VLAEKFGDLD | | PSSAEFFLQE | | ERLTQMRNEY | | ERQCRVLQDQ |
VDELQSELEE | | YRAQGRVLRL | | PLKNSPSEEV | | EANSGGIEPE | | HGLGSEECNP |
LNMSIEAELV | | IEQMKEQHHR | | DICCLRLELE | | DKVRHYEKQL | | DETVVSCKKA |
QENMKQRHEN | | ETHTLEKQIS | | DLKNEIAELQ | | GQAAVLKEAH | | HEATCRHEEE |
KKQLQVKLEE | | EKTHLQEKLR | | LQHEMELKAR | | LTQAQASFER | | EREGLQSSAW |
TEEKVRGLTQ | | ELEQFHQEQL | | TSLVEKHTLE | | KEELRKELLE | | KHQRELQEGR |
EKMETECNRR | | TSQIEAQFQS | | DCQKVTERCE | | SALQSLEGRY | | RQELKDLQEQ |
QREEKSQWEF | | EKDELTQECA | | EAQELLKETL | | KREKTTSLVL | | TQEREMLEKT |
YKEHLNSMVV | | ERQQLLQDLE | | DLRNVSETQQ | | SLLSDQILEL | | KSSHKRELRE |
REEVLCQAGA | | SEQLASQRLE | | RLEMEHDQER | | QEMMSKLLAM | | ENIHKATCET |
ADRERAEMST | | EISRLQSKIK | | EMQQATSPLS | | MLQSGCQVIG | | EEEVEGDGAL |
SLLQQGEQLL | | EENGDVLLSL | | QRAHEQAVKE | | NVKMATEISR | | LQQRLQKLEP |
GLVMSSCLDE | | PATEFFGNTA | | EQTEQFLQQN | | RTKQVEGVTR | | RHVLSDLEDD |
EVRDLGSTGT | | SSVQRQEVKI | | EESEASVEGF | | SELENSEETR | | TESWELKNQI |
SQLQEQLMML | | CADCDRASEK | | KQDLLFDVSV | | LKKKLKMLER | | IPEASPKYKL |
LYEDVSREND | | CLQEELRMME | | TRYDEALENN | | KELTAEVFRL | | QDELKKMEEV |
TETFLSLEKS | | YDEVKIENEG | | LNVLVLRLQG | | KIEKLQESVV | | QRCDCCLWEA |
SLENLEIEPD | | GNILQLNQTL | | EECVPRVRSV | | HHVIEECKQE | | NQYLEGNTQL |
LEKVKAHEIA | | WLHGTIQTHQ | | ERPRVQNQVI | | LEENTTLLGF | | QDKHFQHQAT |
IAELELEKTK | | LQELTRKLKE | | RVTILVKQKD | | VLSHGEKEEE | | LKAMMHDLQI |
TCSEMQQKVE | | LLRYESEKLQ | | QENSILRNEI | | TTLNEEDSIS | | NLKLGTLNGS |
QEEMWQKTET | | VKQENAAVQK | | MVENLKKQIS | | ELKIKNQQLD | | LENTELSQKN |
SQNQEKLQEL | | NQRLTEMLCQ | | KEKEPGNSAL | | EEREQEKFNL | | KEELERCKVQ |
SSTLVSSLEA | | ELSEVKIQTH | | IVQQENHLLK | | DELEKMKQLH | | RCPDLSDFQQ |
KISSVLSYNE | | KLLKEKEALS | | EELNSCVDKL | | AKSSLLEHRI | | ATMKQEQKSW |
EHQSASLKSQ | | LVASQEKVQN | | LEDTVQNVNL | | QMSRMKSDLR | | VTQQEKEALK |
QEVMSLHKQL | | QNAGGKSWAP | | EIATHPSGLH | | NQQKRLSWDK | | LDHLMNEEQQ |
LLWQENERLQ | | TMVQNTKAEL | | THSREKVRQL | | ESNLLPKHQK | | HLNPSGTMNP |
TEQEKLSLKR | | ECDQFQKEQS | | PANRKVSQMN | | SLEQELETIH | | LENEGLKKKQ |
VKLDEQLMEM | | QHLRSTATPS | | PSPHAWDLQL | | LQQQACPMVP | | REQFLQLQRQ |
LLQAERINQH | | LQEELENRTS | | ETNTPQGNQE | | QLVTVMEERM | | IEVEQKLKLV |
KRLLQEKVNQ | | LKEQVSLPGH | | LCSPTSHSSF | | NSSFTSLYCH |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- Hong Y.-R., Chen C.-H., Chuo M.-H., Liou S.-Y., Howng S.-L. (2000). Genomic organization and molecular characterization of the human ninein gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 279: 989—995. PMID 11162463 DOI:10.1006/bbrc.2000.4050
- Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Dammermann A., Merdes A. (2002). Assembly of centrosomal proteins and microtubule organization depends on PCM-1. J. Cell Biol. 159: 255—266. PMID 12403812 DOI:10.1083/jcb.200204023
- Fritzler M.J., Zhang M., Stinton L.M., Rattner J.B. (2003). Spectrum of centrosome autoantibodies in childhood varicella and post-varicella acute cerebellar ataxia. BMC Pediatr. 3: 11—11. PMID 14503922 DOI:10.1186/1471-2431-3-11
- Kodani A., Salome Sirerol-Piquer M., Seol A., Garcia-Verdugo J.M., Reiter J.F. (2013). Kif3a interacts with Dynactin subunit p150 Glued to organize centriole subdistal appendages. EMBO J. 32: 597—607. PMID 23386061 DOI:10.1038/emboj.2013.3
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з NIN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Ninein переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14906 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q8N4C6 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |