COL19A1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | COL19A1, COL9A1L, D6S228E, collagen type XIX alpha 1, collagen type XIX alpha 1 chain |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 120165 MGI: 1095415 HomoloGene: 55608 GeneCards: COL19A1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein-macromolecule adaptor activity • extracellular matrix structural constituent • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength |
---|
Клітинна компонента | • endoplasmic reticulum lumen • колаген • extracellular region • GO:0005578 Позаклітинна матриця • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • collagen catabolic process • multicellular organism development • skeletal system development • диференціація клітин • muscle organ development • skeletal muscle tissue development • extracellular matrix organization • адгезія клітин • cell-cell adhesion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 69.87 – 70.21 Mb | Хр. 1: 24.3 – 24.63 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
COL19A1 (англ. Collagen type XIX alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 142 амінокислот, а молекулярна маса — 115 221[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRLTGPWKLW | | LWMSIFLLPA | | STSVTVRDKT | | EESCPILRIE | | GHQLTYDNIN |
KLEVSGFDLG | | DSFSLRRAFC | | ESDKTCFKLG | | SALLIRDTIK | | IFPKGLPEEY |
SVAAMFRVRR | | NAKKERWFLW | | QVLNQQNIPQ | | ISIVVDGGKK | | VVEFMFQATE |
GDVLNYIFRN | | RELRPLFDRQ | | WHKLGISIQS | | QVISLYMDCN | | LIARRQTDEK |
DTVDFHGRTV | | IATRASDGKP | | VDIELHQLKI | | YCSANLIAQE | | TCCEISDTKC |
PEQDGFGNIA | | SSWVTAHASK | | MSSYLPAKQE | | LKDQCQCIPN | | KGEAGLPGAP |
GSPGQKGHKG | | EPGENGLHGA | | PGFPGQKGEQ | | GFEGSKGETG | | EKGEQGEKGD |
PALAGLNGEN | | GLKGDLGPHG | | PPGPKGEKGD | | TGPPGPPALP | | GSLGIQGPQG |
PPGKEGQRGR | | RGKTGPPGKP | | GPPGPPGPPG | | IQGIHQTLGG | | YYNKDNKGND |
EHEAGGLKGD | | KGETGLPGFP | | GSVGPKGQKG | | EPGEPFTKGE | | KGDRGEPGVI |
GSQGVKGEPG | | DPGPPGLIGS | | PGLKGQQGSA | | GSMGPRGPPG | | DVGLPGEHGI |
PGKQGIKGEK | | GDPGGIIGPP | | GLPGPKGEAG | | PPGKSLPGEP | | GLDGNPGAPG |
PRGPKGERGL | | PGVHGSPGDI | | GPQGIGIPGR | | TGAQGPAGEP | | GIQGPRGLPG |
LPGTPGTPGN | | DGVPGRDGKP | | GLPGPPGDPI | | ALPLLGDIGA | | LLKNFCGNCQ |
ASVPGLKSNK | | GEEGGAGEPG | | KYDSMARKGD | | IGPRGPPGIP | | GREGPKGSKG |
ERGYPGIPGE | | KGDEGLQGIP | | GIPGAPGPTG | | PPGLMGRTGH | | PGPTGAKGEK |
GSDGPPGKPG | | PPGPPGIPFN | | ERNGMSSLYK | | IKGGVNVPSY | | PGPPGPPGPK |
GDPGPVGEPG | | AMGLPGLEGF | | PGVKGDRGPA | | GPPGIAGMSG | | KPGAPGPPGV |
PGEPGERGPV | | GDIGFPGPEG | | PSGKPGINGK | | DGIPGAQGIM | | GKPGDRGPKG |
ERGDQGIPGD | | RGSQGERGKP | | GLTGMKGAIG | | PMGPPGNKGS | | MGSPGHQGPP |
GSPGIPGIPA | | DAVSFEEIKK | | YINQEVLRIF | | EERMAVFLSQ | | LKLPAAMLAA |
QAYGRPGPPG | | KDGLPGPPGD | | PGPQGYRGQK | | GERGEPGIGL | | PGSPGLPGTS |
ALGLPGSPGA | | PGPQGPPGPS | | GRCNPEDCLY | | PVSHAHQRTG | | GN |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, диференціація клітин, міогенез. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Inoguchi K., Yoshioka H., Khaleduzzaman M., Ninomiya Y. (1995). The mRNA for alpha 1(XIX) collagen chain, a new member of FACITs, contains a long unusual 3' untranslated region and displays many unique splicing variants. J. Biochem. 117: 137—146. PMID 7775380
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2196 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q14993 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |