LAMA2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4YEP, 4YEQ | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | LAMA2, LAMM, Laminin, alpha 2, laminin subunit alpha 2, MDC1A |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 156225 MGI: 99912 HomoloGene: 37306 GeneCards: LAMA2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
бічний аміотрофічний склероз, аметропія, congenital merosin-deficient muscular dystrophy 1A[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
ocriplasmin[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • structural molecule activity • signaling receptor binding • extracellular matrix structural constituent |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • dendritic spine • Сарколема • базальна мембрана • GO:0005578 Позаклітинна матриця • neuromuscular junction • synaptic cleft • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • muscle organ development • regulation of cell migration • positive regulation of synaptic transmission, cholinergic • regulation of embryonic development • regulation of cell adhesion • axon guidance • адгезія клітин • Schwann cell differentiation • extracellular matrix organization • animal organ morphogenesis • гістогенез |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 128.88 – 129.52 Mb | Хр. 10: 26.86 – 27.5 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LAMA2 (англ. Laminin subunit alpha 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 122 амінокислот, а молекулярна маса — 343 905[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPGAAGVLLL | | LLLSGGLGGV | | QAQRPQQQRQ | | SQAHQQRGLF | | PAVLNLASNA |
LITTNATCGE | | KGPEMYCKLV | | EHVPGQPVRN | | PQCRICNQNS | | SNPNQRHPIT |
NAIDGKNTWW | | QSPSIKNGIE | | YHYVTITLDL | | QQVFQIAYVI | | VKAANSPRPG |
NWILERSLDD | | VEYKPWQYHA | | VTDTECLTLY | | NIYPRTGPPS | | YAKDDEVICT |
SFYSKIHPLE | | NGEIHISLIN | | GRPSADDPSP | | ELLEFTSARY | | IRLRFQRIRT |
LNADLMMFAH | | KDPREIDPIV | | TRRYYYSVKD | | ISVGGMCICY | | GHARACPLDP |
ATNKSRCECE | | HNTCGDSCDQ | | CCPGFHQKPW | | RAGTFLTKTE | | CEACNCHGKA |
EECYYDENVA | | RRNLSLNIRG | | KYIGGGVCIN | | CTQNTAGINC | | ETCTDGFFRP |
KGVSPNYPRP | | CQPCHCDPIG | | SLNEVCVKDE | | KHARRGLAPG | | SCHCKTGFGG |
VSCDRCARGY | | TGYPDCKACN | | CSGLGSKNED | | PCFGPCICKE | | NVEGGDCSRC |
KSGFFNLQED | | NWKGCDECFC | | SGVSNRCQSS | | YWTYGKIQDM | | SGWYLTDLPG |
RIRVAPQQDD | | LDSPQQISIS | | NAEARQALPH | | SYYWSAPAPY | | LGNKLPAVGG |
QLTFTISYDL | | EEEEEDTERV | | LQLMIILEGN | | DLSISTAQDE | | VYLHPSEEHT |
NVLLLKEESF | | TIHGTHFPVR | | RKEFMTVLAN | | LKRVLLQITY | | SFGMDAIFRL |
SSVNLESAVS | | YPTDGSIAAA | | VEVCQCPPGY | | TGSSCESCWP | | RHRRVNGTIF |
GGICEPCQCF | | GHAESCDDVT | | GECLNCKDHT | | GGPYCDKCLP | | GFYGEPTKGT |
SEDCQPCACP | | LNIPSNNFSP | | TCHLDRSLGL | | ICDGCPVGYT | | GPRCERCAEG |
YFGQPSVPGG | | SCQPCQCNDN | | LDFSIPGSCD | | SLSGSCLICK | | PGTTGRYCEL |
CADGYFGDAV | | DAKNCQPCRC | | NAGGSFSEVC | | HSQTGQCECR | | ANVQGQRCDK |
CKAGTFGLQS | | ARGCVPCNCN | | SFGSKSFDCE | | ESGQCWCQPG | | VTGKKCDRCA |
HGYFNFQEGG | | CTACECSHLG | | NNCDPKTGRC | | ICPPNTIGEK | | CSKCAPNTWG |
HSITTGCKAC | | NCSTVGSLDF | | QCNVNTGQCN | | CHPKFSGAKC | | TECSRGHWNY |
PRCNLCDCFL | | PGTDATTCDS | | ETKKCSCSDQ | | TGQCTCKVNV | | EGIHCDRCRP |
GKFGLDAKNP | | LGCSSCYCFG | | TTTQCSEAKG | | LIRTWVTLKA | | EQTILPLVDE |
ALQHTTTKGI | | VFQHPEIVAH | | MDLMREDLHL | | EPFYWKLPEQ | | FEGKKLMAYG |
GKLKYAIYFE | | AREETGFSTY | | NPQVIIRGGT | | PTHARIIVRH | | MAAPLIGQLT |
RHEIEMTEKE | | WKYYGDDPRV | | HRTVTREDFL | | DILYDIHYIL | | IKATYGNFMR |
QSRISEISME | | VAEQGRGTTM | | TPPADLIEKC | | DCPLGYSGLS | | CEACLPGFYR |
LRSQPGGRTP | | GPTLGTCVPC | | QCNGHSSLCD | | PETSICQNCQ | | HHTAGDFCER |
CALGYYGIVK | | GLPNDCQQCA | | CPLISSSNNF | | SPSCVAEGLD | | DYRCTACPRG |
YEGQYCERCA | | PGYTGSPGNP | | GGSCQECECD | | PYGSLPVPCD | | PVTGFCTCRP |
GATGRKCDGC | | KHWHAREGWE | | CVFCGDECTG | | LLLGDLARLE | | QMVMSINLTG |
PLPAPYKMLY | | GLENMTQELK | | HLLSPQRAPE | | RLIQLAEGNL | | NTLVTEMNEL |
LTRATKVTAD | | GEQTGQDAER | | TNTRAKSLGE | | FIKELARDAE | | AVNEKAIKLN |
ETLGTRDEAF | | ERNLEGLQKE | | IDQMIKELRR | | KNLETQKEIA | | EDELVAAEAL |
LKKVKKLFGE | | SRGENEEMEK | | DLREKLADYK | | NKVDDAWDLL | | REATDKIREA |
NRLFAVNQKN | | MTALEKKKEA | | VESGKRQIEN | | TLKEGNDILD | | EANRLADEIN |
SIIDYVEDIQ | | TKLPPMSEEL | | NDKIDDLSQE | | IKDRKLAEKV | | SQAESHAAQL |
NDSSAVLDGI | | LDEAKNISFN | | ATAAFKAYSN | | IKDYIDEAEK | | VAKEAKDLAH |
EATKLATGPR | | GLLKEDAKGC | | LQKSFRILNE | | AKKLANDVKE | | NEDHLNGLKT |
RIENADARNG | | DLLRTLNDTL | | GKLSAIPNDT | | AAKLQAVKDK | | ARQANDTAKD |
VLAQITELHQ | | NLDGLKKNYN | | KLADSVAKTN | | AVVKDPSKNK | | IIADADATVK |
NLEQEADRLI | | DKLKPIKELE | | DNLKKNISEI | | KELINQARKQ | | ANSIKVSVSS |
GGDCIRTYKP | | EIKKGSYNNI | | VVNVKTAVAD | | NLLFYLGSAK | | FIDFLAIEMR |
KGKVSFLWDV | | GSGVGRVEYP | | DLTIDDSYWY | | RIVASRTGRN | | GTISVRALDG |
PKASIVPSTH | | HSTSPPGYTI | | LDVDANAMLF | | VGGLTGKLKK | | ADAVRVITFT |
GCMGETYFDN | | KPIGLWNFRE | | KEGDCKGCTV | | SPQVEDSEGT | | IQFDGEGYAL |
VSRPIRWYPN | | ISTVMFKFRT | | FSSSALLMYL | | ATRDLRDFMS | | VELTDGHIKV |
SYDLGSGMAS | | VVSNQNHNDG | | KWKSFTLSRI | | QKQANISIVD | | IDTNQEENIA |
TSSSGNNFGL | | DLKADDKIYF | | GGLPTLRNLS | | MKARPEVNLK | | KYSGCLKDIE |
ISRTPYNILS | | SPDYVGVTKG | | CSLENVYTVS | | FPKPGFVELS | | PVPIDVGTEI |
NLSFSTKNES | | GIILLGSGGT | | PAPPRRKRRQ | | TGQAYYAILL | | NRGRLEVHLS |
TGARTMRKIV | | IRPEPNLFHD | | GREHSVHVER | | TRGIFTVQVD | | ENRRYMQNLT |
VEQPIEVKKL | | FVGGAPPEFQ | | PSPLRNIPPF | | EGCIWNLVIN | | SVPMDFARPV |
SFKNADIGRC | | AHQKLREDED | | GAAPAEIVIQ | | PEPVPTPAFP | | TPTPVLTHGP |
CAAESEPALL | | IGSKQFGLSR | | NSHIAIAFDD | | TKVKNRLTIE | | LEVRTEAESG |
LLFYMARINH | | ADFATVQLRN | | GLPYFSYDLG | | SGDTHTMIPT | | KINDGQWHKI |
KIMRSKQEGI | | LYVDGASNRT | | ISPKKADILD | | VVGMLYVGGL | | PINYTTRRIG |
PVTYSIDGCV | | RNLHMAEAPA | | DLEQPTSSFH | | VGTCFANAQR | | GTYFDGTGFA |
KAVGGFKVGL | | DLLVEFEFRT | | TTTTGVLLGI | | SSQKMDGMGI | | EMIDEKLMFH |
VDNGAGRFTA | | VYDAGVPGHL | | CDGQWHKVTA | | NKIKHRIELT | | VDGNQVEAQS |
PNPASTSADT | | NDPVFVGGFP | | DDLKQFGLTT | | SIPFRGCIRS | | LKLTKGTGKP |
LEVNFAKALE | | LRGVQPVSCP | | AN |
Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Zhang X., Vuolteenaho R., Tryggvason K. (1996). Structure of the human laminin alpha2-chain gene (LAMA2), which is affected in congenital muscular dystrophy. J. Biol. Chem. 271: 27664—27669. PMID 8910357 DOI:10.1074/jbc.271.44.27664
- Ehrig K., Leivo I., Argraves W.S., Ruoslahti E., Engvall E. (1990). Merosin, a tissue-specific basement membrane protein, is a laminin-like protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 3264—3268. PMID 2185464 DOI:10.1073/pnas.87.9.3264
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з LAMA2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Laminin subunit alpha 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6482 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P24043 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |