LAMA1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | LAMA1, LAMA, S-LAM-alpha, PTBHS, Laminin, alpha 1, laminin subunit alpha 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 150320 MGI: 99892 HomoloGene: 21146 GeneCards: LAMA1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
цукровий діабет 2-го типу, ataxia-intellectual disability-oculomotor apraxia-cerebellar cysts syndrome[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
ocriplasmin[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • signaling receptor binding • extracellular matrix structural constituent • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein C-terminus binding • glycosphingolipid binding |
---|
Клітинна компонента | • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • базальна мембрана • laminin-1 complex • laminin-3 complex • міжклітинний простір • мембрана • cell-cell junction • laminin complex • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • cell surface receptor signaling pathway • regulation of cell adhesion • адгезія клітин • extracellular matrix organization • regulation of cell migration • regulation of embryonic development • morphogenesis of an epithelial sheet • protein phosphorylation • гістогенез • neuron projection development • establishment of epithelial cell apical/basal polarity • retina development in camera-type eye • epithelial tube branching involved in lung morphogenesis • branching involved in salivary gland morphogenesis • retinal blood vessel morphogenesis • axon guidance • animal organ morphogenesis • camera-type eye development • blood vessel morphogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 18: 6.94 – 7.12 Mb | Хр. 17: 68 – 68.13 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LAMA1 (англ. Laminin subunit alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 075 амінокислот, а молекулярна маса — 337 084[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRGGVLLVLL | | LCVAAQCRQR | | GLFPAILNLA | | SNAHISTNAT | | CGEKGPEMFC |
KLVEHVPGRP | | VRNPQCRICD | | GNSANPRERH | | PISHAIDGTN | | NWWQSPSIQN |
GREYHWVTIT | | LDLRQVFQVA | | YVIIKAANAP | | RPGNWILERS | | LDGTTFSPWQ |
YYAVSDSECL | | SRYNITPRRG | | PPTYRADDEV | | ICTSYYSRLV | | PLEHGEIHTS |
LINGRPSADD | | LSPKLLEFTS | | ARYIRLRLQR | | IRTLNADLMT | | LSHREPKELD |
PIVTRRYYYS | | IKDISVGGMC | | ICYGHASSCP | | WDETTKKLQC | | QCEHNTCGES |
CNRCCPGYHQ | | QPWRPGTVSS | | GNTCEACNCH | | NKAKDCYYDE | | SVAKQKKSLN |
TAGQFRGGGV | | CINCLQNTMG | | INCETCIDGY | | YRPHKVSPYE | | DEPCRPCNCD |
PVGSLSSVCI | | KDDLHSDLHN | | GKQPGQCPCK | | EGYTGEKCDR | | CQLGYKDYPT |
CVSCGCNPVG | | SASDEPCTGP | | CVCKENVEGK | | ACDRCKPGFY | | NLKEKNPRGC |
SECFCFGVSD | | VCSSLSWPVG | | QVNSMSGWLV | | TDLISPRKIP | | SQQDALGGRH |
QVSINNTAVM | | QRLAPKYYWA | | APEAYLGNKL | | TAFGGFLKYT | | VSYDIPVETV |
DSNLMSHADV | | IIKGNGLTLS | | TQAEGLSLQP | | YEEYLNVVRL | | VPENFQDFHS |
KRQIDRDQLM | | TVLANVTHLL | | IRANYNSAKM | | ALYRLESVSL | | DIASSNAIDL |
VVAADVEHCE | | CPQGYTGTSC | | ESCLSGYYRV | | DGILFGGICQ | | PCECHGHAAE |
CNVHGVCIAC | | AHNTTGVHCE | | QCLPGFYGEP | | SRGTPGDCQP | | CACPLTIASN |
NFSPTCHLND | | GDEVVCDWCA | | PGYSGAWCER | | CADGYYGNPT | | VPGESCVPCD |
CSGNVDPSEA | | GHCDSVTGEC | | LKCLGNTDGA | | HCERCADGFY | | GDAVTAKNCR |
ACECHVKGSH | | SAVCHLETGL | | CDCKPNVTGQ | | QCDQCLHGYY | | GLDSGHGCRP |
CNCSVAGSVS | | DGCTDEGQCH | | CVPGVAGKRC | | DRCAHGFYAY | | QDGSCTPCDC |
PHTQNTCDPE | | TGECVCPPHT | | QGVKCEECED | | GHWGYDAEVG | | CQACNCSLVG |
STHHRCDVVT | | GHCQCKSKFG | | GRACDQCSLG | | YRDFPDCVPC | | DCDLRGTSGD |
ACNLEQGLCG | | CVEETGACPC | | KENVFGPQCN | | ECREGTFALR | | ADNPLGCSPC |
FCSGLSHLCS | | ELEDYVRTPV | | TLGSDQPLLR | | VVSQSNLRGT | | TEGVYYQAPD |
FLLDAATVRQ | | HIRAEPFYWR | | LPQQFQGDQL | | MAYGGKLKYS | | VAFYSLDGVG |
TSNFEPQVLI | | KGGRIRKQVI | | YMDAPAPENG | | VRQEQEVAMR | | ENFWKYFNSV |
SEKPVTREDF | | MSVLSDIEYI | | LIKASYGQGL | | QQSRISDISM | | EVGRKAEKLH |
PEEEVASLLE | | NCVCPPGTVG | | FSCQDCAPGY | | HRGKLPAGSD | | RGPRPLVAPC |
VPCSCNNHSD | | TCDPNTGKCL | | NCGDNTAGDH | | CDVCTSGYYG | | KVTGSASDCA |
LCACPHSPPA | | SFSPTCVLEG | | DHDFRCDACL | | LGYEGKHCER | | CSSSYYGNPQ |
TPGGSCQKCD | | CNPHGSVHGD | | CDRTSGQCVC | | RLGASGLRCD | | ECEPRHILME |
TDCVSCDDEC | | VGVLLNDLDE | | IGDAVLSLNL | | TGIIPVPYGI | | LSNLENTTKY |
LQESLLKENM | | QKDLGKIKLE | | GVAEETDNLQ | | KKLTRMLAST | | QKVNRATERI |
FKESQDLAIA | | IERLQMSITE | | IMEKTTLNQT | | LDEDFLLPNS | | TLQNMQQNGT |
SLLEIMQIRD | | FTQLHQNATL | | ELKAAEDLLS | | QIQENYQKPL | | EELEVLKEAA |
SHVLSKHNNE | | LKAAEALVRE | | AEAKMQESNH | | LLLMVNANLR | | EFSDKKLHVQ |
EEQNLTSELI | | VQGRGLIDAA | | AAQTDAVQDA | | LEHLEDHQDK | | LLLWSAKIRH |
HIDDLVMHMS | | QRNAVDLVYR | | AEDHAAEFQR | | LADVLYSGLE | | NIRNVSLNAT |
SAAYVHYNIQ | | SLIEESEELA | | RDAHRTVTET | | SLLSESLVSN | | GKAAVQRSSR |
FLKEGNNLSR | | KLPGIALELS | | ELRNKTNRFQ | | ENAVEITRQT | | NESLLILRAI |
PKGIRDKGAK | | TKELATSASQ | | SAVSTLRDVA | | GLSQELLNTS | | ASLSRVNTTL |
RETHQLLQDS | | TMATLLAGRK | | VKDVEIQANL | | LFDRLKPLKM | | LEENLSRNLS |
EIKLLISQAR | | KQAASIKVAV | | SADRDCIRAY | | QPQISSTNYN | | TLTLNVKTQE |
PDNLLFYLGS | | STASDFLAVE | | MRRGRVAFLW | | DLGSGSTRLE | | FPDFPIDDNR |
WHSIHVARFG | | NIGSLSVKEM | | SSNQKSPTKT | | SKSPGTANVL | | DVNNSTLMFV |
GGLGGQIKKS | | PAVKVTHFKG | | CLGEAFLNGK | | SIGLWNYIER | | EGKCRGCFGS |
SQNEDPSFHF | | DGSGYSVVEK | | SLPATVTQII | | MLFNTFSPNG | | LLLYLGSYGT |
KDFLSIELFR | | GRVKVMTDLG | | SGPITLLTDR | | RYNNGTWYKI | | AFQRNRKQGV |
LAVIDAYNTS | | NKETKQGETP | | GASSDLNRLD | | KDPIYVGGLP | | RSRVVRRGVT |
TKSFVGCIKN | | LEISRSTFDL | | LRNSYGVRKG | | CLLEPIRSVS | | FLKGGYIELP |
PKSLSPESEW | | LVTFATTNSS | | GIILAALGGD | | VEKRGDREEA | | HVPFFSVMLI |
GGNIEVHVNP | | GDGTGLRKAL | | LHAPTGTCSD | | GQAHSISLVR | | NRRIITVQLD |
ENNPVEMKLG | | TLVESRTINV | | SNLYVGGIPE | | GEGTSLLTMR | | RSFHGCIKNL |
IFNLELLDFN | | SAVGHEQVDL | | DTCWLSERPK | | LAPDAEDSKL | | LPEPRAFPEQ |
CVVDAALEYV | | PGAHQFGLTQ | | NSHFILPFNQ | | SAVRKKLSVE | | LSIRTFASSG |
LIYYMAHQNQ | | ADYAVLQLHG | | GRLHFMFDLG | | KGRTKVSHPA | | LLSDGKWHTV |
KTDYVKRKGF | | ITVDGRESPM | | VTVVGDGTML | | DVEGLFYLGG | | LPSQYQARKI |
GNITHSIPAC | | IGDVTVNSKQ | | LDKDSPVSAF | | TVNRCYAVAQ | | EGTYFDGSGY |
AALVKEGYKV | | QSDVNITLEF | | RTSSQNGVLL | | GISTAKVDAI | | GLELVDGKVL |
FHVNNGAGRI | | TAAYEPKTAT | | VLCDGKWHTL | | QANKSKHRIT | | LIVDGNAVGA |
ESPHTQSTSV | | DTNNPIYVGG | | YPAGVKQKCL | | RSQTSFRGCL | | RKLALIKSPQ |
VQSFDFSRAF | | ELHGVFLHSC | | PGTES |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Nissinen M., Vuolteenaho R., Boot-Handford R., Kallunki P., Tryggvason K. (1991). Primary structure of the human laminin A chain. Limited expression in human tissues. Biochem. J. 276: 369—379. PMID 2049067 DOI:10.1042/bj2760369
- Haaparanta T., Uitto J., Ruoslahti E., Engvall E. (1991). Molecular cloning of the cDNA encoding human laminin A chain. Matrix. 11: 151—160. PMID 1714537
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з LAMA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Laminin subunit alpha 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6481 (англ.) . Архів оригіналу за 17 квітня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P25391 (англ.) . Архів оригіналу за 12 грудня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |