DAG1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1EG4, 2MK7 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | DAG1, 156DAG, A3a, AGRNR, DAG, MDDGC7, MDDGC9, MDDGA9, dystroglycan 1, LGMDR16 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 128239 MGI: 101864 HomoloGene: 3234 GeneCards: DAG1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2P, muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies), type A, 9[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • virus receptor activity • alpha-actinin binding • vinculin binding • actin binding • tubulin binding • structural constituent of muscle • SH2 domain binding • laminin binding • laminin-1 binding • dystroglycan binding |
---|
Клітинна компонента | • cell-cell junction • клітинне ядро • синапс • contractile ring • Філоподія • node of Ranvier • costamere • lamellipodium • dystroglycan complex • membrane raft • міжклітинні контакти • цитоскелет • мембрана • екзосома • basolateral plasma membrane • postsynaptic membrane • Сарколема • цитоплазма • integral component of membrane • focal adhesion • клітинна мембрана • dystrophin-associated glycoprotein complex • нуклеоплазма • базальна мембрана • гіалоплазма • міжклітинний простір • endoplasmic reticulum lumen • Golgi lumen • plasma membrane raft • external side of plasma membrane • nuclear periphery • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • postsynaptic cytosol |
---|
Біологічний процес | • NLS-bearing protein import into nucleus • extracellular matrix organization • GO:0022415 viral process • regulation of embryonic cell shape • response to peptide hormone • regulation of epithelial to mesenchymal transition • positive regulation of basement membrane assembly involved in embryonic body morphogenesis • viral entry into host cell • regulation of gastrulation • negative regulation of cell migration • Schwann cell development • membrane protein ectodomain proteolysis • calcium-dependent cell-matrix adhesion • negative regulation of MAPK cascade • nerve maturation • microtubule anchoring • commissural neuron axon guidance • branching involved in salivary gland morphogenesis • negative regulation of protein kinase B signaling • morphogenesis of an epithelial sheet • myelination in peripheral nervous system • basement membrane organization • epithelial tube branching involved in lung morphogenesis • modulation by virus of host process • protein O-linked glycosylation • positive regulation of cell-matrix adhesion • GO:0010260 старіння людини • Schwann cell differentiation • response to denervation involved in regulation of muscle adaptation • nerve development • axon regeneration • positive regulation of myelination • skeletal muscle tissue regeneration • positive regulation of protein kinase activity • positive regulation of oligodendrocyte differentiation • cellular response to mechanical stimulus • cellular response to cholesterol • angiogenesis involved in wound healing • GO:1904739 regulation of synapse organization • regulation of neurotransmitter receptor localization to postsynaptic specialization membrane • retrograde trans-synaptic signaling by trans-synaptic protein complex |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_004393 NM_001165928 NM_001177634 NM_001177635 NM_001177636
| NM_001177637 NM_001177638 NM_001177639 NM_001177640 NM_001177641 NM_001177642 NM_001177643 NM_001177644 |
| NM_001276481 NM_001276482 NM_001276485 NM_001276486 NM_001276492
| NM_001276493 NM_001276494 NM_010017 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001159400 NP_001171105 NP_001171106 NP_001171107 NP_001171108
| NP_001171109 NP_001171110 NP_001171111 NP_001171112 NP_001171113 NP_001171114 NP_001171115 NP_004384 |
| NP_001263410 NP_001263411 NP_001263414 NP_001263415 NP_001263421
| NP_001263422 NP_034147 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 49.47 – 49.54 Mb | Хр. 9: 108.08 – 108.14 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
DAG1 (англ. Dystroglycan 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 895 амінокислот, а молекулярна маса — 97 441[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRMSVGLSLL | | LPLSGRTFLL | | LLSVVMAQSH | | WPSEPSEAVR | | DWENQLEASM |
HSVLSDLHEA | | VPTVVGIPDG | | TAVVGRSFRV | | TIPTDLIASS | | GDIIKVSAAG |
KEALPSWLHW | | DSQSHTLEGL | | PLDTDKGVHY | | ISVSATRLGA | | NGSHIPQTSS |
VFSIEVYPED | | HSELQSVRTA | | SPDPGEVVSS | | ACAADEPVTV | | LTVILDADLT |
KMTPKQRIDL | | LHRMRSFSEV | | ELHNMKLVPV | | VNNRLFDMSA | | FMAGPGNAKK |
VVENGALLSW | | KLGCSLNQNS | | VPDIHGVEAP | | AREGAMSAQL | | GYPVVGWHIA |
NKKPPLPKRV | | RRQIHATPTP | | VTAIGPPTTA | | IQEPPSRIVP | | TPTSPAIAPP |
TETMAPPVRD | | PVPGKPTVTI | | RTRGAIIQTP | | TLGPIQPTRV | | SEAGTTVPGQ |
IRPTMTIPGY | | VEPTAVATPP | | TTTTKKPRVS | | TPKPATPSTD | | STTTTTRRPT |
KKPRTPRPVP | | RVTTKVSITR | | LETASPPTRI | | RTTTSGVPRG | | GEPNQRPELK |
NHIDRVDAWV | | GTYFEVKIPS | | DTFYDHEDTT | | TDKLKLTLKL | | REQQLVGEKS |
WVQFNSNSQL | | MYGLPDSSHV | | GKHEYFMHAT | | DKGGLSAVDA | | FEIHVHRRPQ |
GDRAPARFKA | | KFVGDPALVL | | NDIHKKIALV | | KKLAFAFGDR | | NCSTITLQNI |
TRGSIVVEWT | | NNTLPLEPCP | | KEQIAGLSRR | | IAEDDGKPRP | | AFSNALEPDF |
KATSITVTGS | | GSCRHLQFIP | | VVPPRRVPSE | | APPTEVPDRD | | PEKSSEDDVY |
LHTVIPAVVV | | AAILLIAGII | | AMICYRKKRK | | GKLTLEDQAT | | FIKKGVPIIF |
ADELDDSKPP | | PSSSMPLILQ | | EEKAPLPPPE | | YPNQSVPETT | | PLNQDTMGEY |
TPLRDEDPNA | | PPYQPPPPFT | | APMEGKGSRP | | KNMTPYRSPP | | PYVPP |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних контактах, синапсах. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Jung D., Yang B., Meyer J., Chamberlain J.S., Campbell K.P. (1995). Identification and characterization of the dystrophin anchoring site on beta-dystroglycan. J. Biol. Chem. 270: 27305—27310. PMID 7592992 DOI:10.1074/jbc.270.45.27305
- Tommasi di Vignano A., Di Zenzo G., Sudol M., Cesareni G., Dente L. (2000). Contribution of the different modules in the utrophin carboxy-terminal region to the formation and regulation of the DAP complex. FEBS Lett. 471: 229—234. PMID 10767429 DOI:10.1016/S0014-5793(00)01400-9
- Ilsley J.L., Sudol M., Winder S.J. (2001). The interaction of dystrophin with beta-dystroglycan is regulated by tyrosine phosphorylation. Cell. Signal. 13: 625—632. PMID 11495720 DOI:10.1016/S0898-6568(01)00188-7
- Watanabe N., Sasaoka T., Noguchi S., Nishino I., Tanaka T. (2007). Cys669-Cys713 disulfide bridge formation is a key to dystroglycan cleavage and subunit association. Genes Cells. 12: 75—88. PMID 17212656 DOI:10.1111/j.1365-2443.2006.01033.x
- Rojek J.M., Spiropoulou C.F., Campbell K.P., Kunz S. (2007). Old World and clade C New World arenaviruses mimic the molecular mechanism of receptor recognition used by alpha-dystroglycan's host-derived ligands. J. Virol. 81: 5685—5695. PMID 17360738 DOI:10.1128/JVI.02574-06
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з DAG1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2666 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q14118 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
Незгруповані альфа | |
---|
Не-альфа | |
---|
|
---|
Тип 3 | |
---|
Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
Тип 5 | |
---|
|
---|
Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
Катеніни | |
---|
Мембранні | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Нелюдські | |
---|