TPM1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TPM1, C15orf13, CMD1Y, CMH3, HTM-alpha, LVNC9, TMSA, HEL-S-265, tropomyosin 1 (alpha), tropomyosin 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 191010 HomoloGene: 121635 GeneCards: TPM1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
hypertrophic cardiomyopathy 3, dilated cardiomyopathy 1Y, гіпертрофічна кардіоміопатія[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • cytoskeletal protein binding • structural constituent of cytoskeleton • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • structural constituent of muscle • identical protein binding • protein homodimerization activity • protein heterodimerization activity • actin filament binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • muscle thin filament tropomyosin • саркомера • stress fiber • ruffle membrane • bleb • цитоскелет • гіалоплазма • мікрофіламент • actin cytoskeleton • міофібрила • filamentous actin |
---|
Біологічний процес | • regulation of muscle contraction • м'язове скорочення • regulation of heart contraction • positive regulation of ATP-dependent activity • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell migration • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation • ruffle organization • Загоєння ран • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species • negative regulation of cell migration • cytoskeleton organization • regulation of cell shape • muscle filament sliding • sarcomere organization • positive regulation of stress fiber assembly • positive regulation of cell adhesion • actin filament organization • in utero embryonic development • positive regulation of heart rate by epinephrine • ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis • cardiac muscle contraction |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_000366 NM_001018004 NM_001018005 NM_001018006 NM_001018007
| NM_001018008 NM_001018020 NM_001301244 NM_001301289 NM_001330344 NM_001330346 NM_001330351 NM_001365776 NM_001365777 NM_001365778 NM_001365779 NM_001365780 NM_001365781 NM_001365782 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_000357 NP_001018004 NP_001018005 NP_001018006 NP_001018007
| NP_001018008 NP_001018020 NP_001288173 NP_001288218 NP_001317273 NP_001317275 NP_001317280 NP_001352705 NP_001352706 NP_001352707 NP_001352708 NP_001352709 NP_001352710 NP_001352711 NP_001018006.1 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 63.04 – 63.07 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TPM1 (англ. Tropomyosin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 284 амінокислот, а молекулярна маса — 32 709[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDAIKKKMQM | | LKLDKENALD | | RAEQAEADKK | | AAEDRSKQLE | | DELVSLQKKL |
KGTEDELDKY | | SEALKDAQEK | | LELAEKKATD | | AEADVASLNR | | RIQLVEEELD |
RAQERLATAL | | QKLEEAEKAA | | DESERGMKVI | | ESRAQKDEEK | | MEIQEIQLKE |
AKHIAEDADR | | KYEEVARKLV | | IIESDLERAE | | ERAELSEGKC | | AELEEELKTV |
TNNLKSLEAQ | | AEKYSQKEDR | | YEEEIKVLSD | | KLKEAETRAE | | FAERSVTKLE |
KSIDDLEDEL | | YAQKLKYKAI | | SEELDHALND | | MTSI |
Кодований геном білок за функціями належить до м'язових білків, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- Mische S.M., Manjula B.N., Fischetti V.A. (1987). Relation of streptococcal M protein with human and rabbit tropomyosin: the complete amino acid sequence of human cardiac alpha tropomyosin, a highly conserved contractile protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 142: 813—818. PMID 3548719 DOI:10.1016/0006-291X(87)91486-0
- Lin C.-S., Leavitt J. (1988). Cloning and characterization of a cDNA encoding transformation-sensitive tropomyosin isoform 3 from tumorigenic human fibroblasts. Mol. Cell. Biol. 8: 160—168. PMID 3336357 DOI:10.1128/MCB.8.1.160
- McLeod A.R., Gooding C. (1988). Human hTM alpha gene: expression in muscle and nonmuscle tissue. Mol. Cell. Biol. 8: 433—440. PMID 3336363 DOI:10.1128/MCB.8.1.433
- Denz C.R., Narshi A., Zajdel R.W., Dube D.K. (2004). Expression of a novel cardiac-specific tropomyosin isoform in humans. Biochem. Biophys. Res. Commun. 320: 1291—1297. PMID 15249230 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.06.084
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Houle F., Poirier A., Dumaresq J., Huot J. (2007). DAP kinase mediates the phosphorylation of tropomyosin-1 downstream of the ERK pathway, which regulates the formation of stress fibers in response to oxidative stress. J. Cell Sci. 120: 3666—3677. PMID 17895359 DOI:10.1242/jcs.003251
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TPM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12010 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P09493 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
Незгруповані альфа | |
---|
Не-альфа | |
---|
|
---|
Тип 3 | |
---|
Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
Тип 5 | |
---|
|
---|
Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
Катеніни | |
---|
Мембранні | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Нелюдські | |
---|