PKP1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PKP1, B6P, plakophilin 1, EDSFS |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601975 MGI: 1328359 HomoloGene: 253 GeneCards: PKP1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
панічний розлад, Skin fragility syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • structural constituent of skin epidermis • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • intermediate filament binding • signal transducer activity • lamin binding • cadherin binding |
---|
Клітинна компонента | • внутрішньоклітинна мембранна органела • міжклітинні контакти • Проміжні філаменти • нуклеоплазма • клітинна мембрана • клітинне ядро • Десмосома • cornified envelope • ficolin-1-rich granule membrane • messenger ribonucleoprotein complex • цитоплазма • cell-cell junction |
---|
Біологічний процес | • multicellular organism development • intermediate filament bundle assembly • GO:0072468 сигнальна трансдукція • адгезія клітин • keratinization • neutrophil degranulation • cornification • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of mRNA catabolic process • cell-cell adhesion • cell-cell junction assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 201.28 – 201.33 Mb | Хр. 1: 135.8 – 135.85 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PKP1 (англ. Plakophilin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 747 амінокислот, а молекулярна маса — 82 861[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNHSPLKTAL | | AYECFQDQDN | | STLALPSDQK | | MKTGTSGRQR | | VQEQVMMTVK |
RQKSKSSQSS | | TLSHSNRGSM | | YDGLADNYNY | | GTTSRSSYYS | | KFQAGNGSWG |
YPIYNGTLKR | | EPDNRRFSSY | | SQMENWSRHY | | PRGSCNTTGA | | GSDICFMQKI |
KASRSEPDLY | | CDPRGTLRKG | | TLGSKGQKTT | | QNRYSFYSTC | | SGQKAIKKCP |
VRPPSCASKQ | | DPVYIPPISC | | NKDLSFGHSR | | ASSKICSEDI | | ECSGLTIPKA |
VQYLSSQDEK | | YQAIGAYYIQ | | HTCFQDESAK | | QQVYQLGGIC | | KLVDLLRSPN |
QNVQQAAAGA | | LRNLVFRSTT | | NKLETRRQNG | | IREAVSLLRR | | TGNAEIQKQL |
TGLLWNLSST | | DELKEELIAD | | ALPVLADRVI | | IPFSGWCDGN | | SNMSREVVDP |
EVFFNATGCL | | RKRLGMRELL | | ALVPQRATSS | | RVNLSSADAG | | RQTMRNYSGL |
IDSLMAYVQN | | CVAASRCDDK | | SVENCMCVLH | | NLSYRLDAEV | | PTRYRQLEYN |
ARNAYTEKSS | | TGCFSNKSDK | | MMNNNYDCPL | | PEEETNPKGS | | GWLYHSDAIR |
TYLNLMGKSK | | KDATLEACAG | | ALQNLTASKG | | LMSSGMSQLI | | GLKEKGLPQI |
ARLLQSGNSD | | VVRSGASLLS | | NMSRHPLLHR | | VMGNQVFPEV | | TRLLTSHTGN |
TSNSEDILSS | | ACYTVRNLMA | | SQPQLAKQYF | | SSSMLNNIIN | | LCRSSASPKA |
AEAARLLLSD | | MWSSKELQGV | | LRQQGFDRNM | | LGTLAGANSL | | RNFTSRF |
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як клітинна адгезія. Локалізований у ядрі, клітинних контактах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Choi H.-J., Weis W.I. (2005). Structure of the armadillo repeat domain of plakophilin 1. J. Mol. Biol. 346: 367—376. PMID 15663951 DOI:10.1016/j.jmb.2004.11.048
- Hatzfeld M., Kristjansson G.I., Plessmann U., Weber K. (1994). Band 6 protein, a major constituent of desmosomes from stratified epithelia, is a novel member of the armadillo multigene family. J. Cell Sci. 107: 2259—2270. PMID 7527055
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PKP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9023 (англ.) . Архів оригіналу за 1 липня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q13835 (англ.) . Архів оригіналу за 20 грудня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
Незгруповані альфа | |
---|
Не-альфа | |
---|
|
---|
Тип 3 | |
---|
Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
Тип 5 | |
---|
|
---|
Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
Катеніни | |
---|
Мембранні | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Нелюдські | |
---|