MYO5B |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4J5M, 4LNZ, 4LWZ, 4LX0 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | MYO5B, myosin VB, MVID1, DIAR2, PFIC10 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606540 MGI: 106598 HomoloGene: 49481 GeneCards: MYO5B |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
microvillus inclusion disease[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • calmodulin binding • microfilament motor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • cytoskeletal motor activity • ATP binding • actin filament binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • recycling endosome • apical cortex • екзосома • cytoplasmic vesicle membrane • myosin complex • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • renal water homeostasis • protein transport • vesicle-mediated transport • GO:0015915 транспорт • endosomal transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 18: 49.82 – 50.2 Mb | Хр. 18: 74.57 – 74.9 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
MYO5B (англ. Myosin VB) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 848 амінокислот, а молекулярна маса — 213 672[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSVGELYSQC | | TRVWIPDPDE | | VWRSAELTKD | | YKEGDKSLQL | | RLEDETILEY |
PIDVQRNQLP | | FLRNPDILVG | | ENDLTALSYL | | HEPAVLHNLK | | VRFLESNHIY |
TYCGIVLVAI | | NPYEQLPIYG | | QDVIYTYSGQ | | NMGDMDPHIF | | AVAEEAYKQM |
ARDEKNQSII | | VSGESGAGKT | | VSAKYAMRYF | | ATVGGSASET | | NIEEKVLASS |
PIMEAIGNAK | | TTRNDNSSRF | | GKYIQIGFDK | | RYHIIGANMR | | TYLLEKSRVV |
FQADDERNYH | | IFYQLCAAAG | | LPEFKELALT | | SAEDFFYTSQ | | GGDTSIEGVD |
DAEDFEKTRQ | | AFTLLGVKES | | HQMSIFKIIA | | SILHLGSVAI | | QAERDGDSCS |
ISPQDVYLSN | | FCRLLGVEHS | | QMEHWLCHRK | | LVTTSETYVK | | TMSLQQVINA |
RNALAKHIYA | | QLFGWIVEHI | | NKALHTSLKQ | | HSFIGVLDIY | | GFETFEVNSF |
EQFCINYANE | | KLQQQFNSHV | | FKLEQEEYMK | | EQIPWTLIDF | | YDNQPCIDLI |
EAKLGILDLL | | DEECKVPKGT | | DQNWAQKLYD | | RHSSSQHFQK | | PRMSNTAFII |
VHFADKVEYL | | SDGFLEKNRD | | TVYEEQINIL | | KASKFPLVAD | | LFHDDKDPVP |
ATTPGKGSSS | | KISVRSARPP | | MKVSNKEHKK | | TVGHQFRTSL | | HLLMETLNAT |
TPHYVRCIKP | | NDEKLPFHFD | | PKRAVQQLRA | | CGVLETIRIS | | AAGYPSRWAY |
HDFFNRYRVL | | VKKRELANTD | | KKAICRSVLE | | NLIKDPDKFQ | | FGRTKIFFRA |
GQVAYLEKLR | | ADKFRTATIM | | IQKTVRGWLQ | | KVKYHRLKGA | | TLTLQRYCRG |
HLARRLAEHL | | RRIRAAVVLQ | | KHYRMQRARQ | | AYQRVRRAAV | | VIQAFTRAMF |
VRRTYRQVLM | | EHKATTIQKH | | VRGWMARRHF | | QRLRDAAIVI | | QCAFRMLKAR |
RELKALRIEA | | RSAEHLKRLN | | VGMENKVVQL | | QRKIDEQNKE | | FKTLSEQLSV |
TTSTYTMEVE | | RLKKELVHYQ | | QSPGEDTSLR | | LQEEVESLRT | | ELQRAHSERK |
ILEDAHSREK | | DELRKRVADL | | EQENALLKDE | | KEQLNNQILC | | QSKDEFAQNS |
VKENLMKKEL | | EEERSRYQNL | | VKEYSQLEQR | | YDNLRDEMTI | | IKQTPGHRRN |
PSNQSSLESD | | SNYPSISTSE | | IGDTEDALQQ | | VEEIGLEKAA | | MDMTVFLKLQ |
KRVRELEQER | | KKLQVQLEKR | | EQQDSKKVQA | | EPPQTDIDLD | | PNADLAYNSL |
KRQELESENK | | KLKNDLNELR | | KAVADQATQN | | NSSHGSPDSY | | SLLLNQLKLA |
HEELEVRKEE | | VLILRTQIVS | | ADQRRLAGRN | | AEPNINARSS | | WPNSEKHVDQ |
EDAIEAYHGV | | CQTNSKTEDW | | GYLNEDGELG | | LAYQGLKQVA | | RLLEAQLQAQ |
SLEHEEEVEH | | LKAQLEALKE | | EMDKQQQTFC | | QTLLLSPEAQ | | VEFGVQQEIS |
RLTNENLDLK | | ELVEKLEKNE | | RKLKKQLKIY | | MKKAQDLEAA | | QALAQSERKR |
HELNRQVTVQ | | RKEKDFQGML | | EYHKEDEALL | | IRNLVTDLKP | | QMLSGTVPCL |
PAYILYMCIR | | HADYTNDDLK | | VHSLLTSTIN | | GIKKVLKKHN | | DDFEMTSFWL |
SNTCRLLHCL | | KQYSGDEGFM | | TQNTAKQNEH | | CLKNFDLTEY | | RQVLSDLSIQ |
IYQQLIKIAE | | GVLQPMIVSA | | MLENESIQGL | | SGVKPTGYRK | | RSSSMADGDN |
SYCLEAIIRQ | | MNAFHTVMCD | | QGLDPEIILQ | | VFKQLFYMIN | | AVTLNNLLLR |
KDVCSWSTGM | | QLRYNISQLE | | EWLRGRNLHQ | | SGAVQTMEPL | | IQAAQLLQLK |
KKTQEDAEAI | | CSLCTSLSTQ | | QIVKILNLYT | | PLNEFEERVT | | VAFIRTIQAQ |
LQERNDPQQL | | LLDAKHMFPV | | LFPFNPSSLT | | MDSIHIPACL | | NLEFLNEV |
Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, міозинів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою актину, молекулою кальмодуліну. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Erickson R.P., Larson-Thome K., Valenzuela R.K., Whitaker S.E., Shub M.D. (2008). Navajo microvillous inclusion disease is due to a mutation in MYO5B. Am. J. Med. Genet. A. 146A: 3117—3119. PMID 19006234 DOI:10.1002/ajmg.a.32605
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з MYO5B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7603 (англ.) . Архів оригіналу за 20 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9ULV0 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
Незгруповані альфа | |
---|
Не-альфа | |
---|
|
---|
Тип 3 | |
---|
Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
Тип 5 | |
---|
|
---|
Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
Катеніни | |
---|
Мембранні | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Нелюдські | |
---|