NEFM |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | NEFM, NEF3, NF-M, NFM, neurofilament, medium polypeptide, neurofilament medium, neurofilament medium chain |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 162250 MGI: 97314 HomoloGene: 38041 GeneCards: NEFM |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • microtubule binding • structural constituent of cytoskeleton • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • structural molecule activity |
---|
Клітинна компонента | • neurofibrillary tangle • аксон • Проміжні філаменти • neurofilament • intermediate filament cytoskeleton |
---|
Біологічний процес | • neurofilament bundle assembly • axon development |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 24.91 – 24.92 Mb | Хр. 14: 68.32 – 68.36 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NEFM (англ. Neurofilament medium) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 916 амінокислот, а молекулярна маса — 102 472[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSYTLDSLGN | | PSAYRRVTET | | RSSFSRVSGS | | PSSGFRSQSW | | SRGSPSTVSS |
SYKRSMLAPR | | LAYSSAMLSS | | AESSLDFSQS | | SSLLNGGSGP | | GGDYKLSRSN |
EKEQLQGLND | | RFAGYIEKVH | | YLEQQNKEIE | | AEIQALRQKQ | | ASHAQLGDAY |
DQEIRELRAT | | LEMVNHEKAQ | | VQLDSDHLEE | | DIHRLKERFE | | EEARLRDDTE |
AAIRALRKDI | | EEASLVKVEL | | DKKVQSLQDE | | VAFLRSNHEE | | EVADLLAQIQ |
ASHITVERKD | | YLKTDISTAL | | KEIRSQLESH | | SDQNMHQAEE | | WFKCRYAKLT |
EAAEQNKEAI | | RSAKEEIAEY | | RRQLQSKSIE | | LESVRGTKES | | LERQLSDIEE |
RHNHDLSSYQ | | DTIQQLENEL | | RGTKWEMARH | | LREYQDLLNV | | KMALDIEIAA |
YRKLLEGEET | | RFSTFAGSIT | | GPLYTHRPPI | | TISSKIQKPK | | VEAPKLKVQH |
KFVEEIIEET | | KVEDEKSEME | | EALTAITEEL | | AVSMKEEKKE | | AAEEKEEEPE |
AEEEEVAAKK | | SPVKATAPEV | | KEEEGEKEEE | | EGQEEEEEED | | EGAKSDQAEE |
GGSEKEGSSE | | KEEGEQEEGE | | TEAEAEGEEA | | EAKEEKKVEE | | KSEEVATKEE |
LVADAKVEKP | | EKAKSPVPKS | | PVEEKGKSPV | | PKSPVEEKGK | | SPVPKSPVEE |
KGKSPVPKSP | | VEEKGKSPVS | | KSPVEEKAKS | | PVPKSPVEEA | | KSKAEVGKGE |
QKEEEEKEVK | | EAPKEEKVEK | | KEEKPKDVPE | | KKKAESPVKE | | EAVAEVVTIT |
KSVKVHLEKE | | TKEEGKPLQQ | | EKEKEKAGGE | | GGSEEEGSDK | | GAKGSRKEDI |
AVNGEVEGKE | | EVEQETKEKG | | SGREEEKGVV | | TNGLDLSPAD | | EKKGGDKSEE |
KVVVTKTVEK | | ITSEGGDGAT | | KYITKSVTVT | | QKVEEHEETF | | EEKLVSTKKV |
EKVTSHAIVK | | EVTQSD |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Myers M.W., Lazzarini R.A., Lee V.M.-Y., Schlaepfer W.W., Nelson D.L. (1987). The human mid-size neurofilament subunit: a repeated protein sequence and the relationship of its gene to the intermediate filament gene family. EMBO J. 6: 1617—1626. PMID 3608989
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7734 (англ.) . Архів оригіналу за 27 липня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P07197 (англ.) . Архів оригіналу за 3 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
Незгруповані альфа | |
---|
Не-альфа | |
---|
|
---|
Тип 3 | |
---|
Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
Тип 5 | |
---|
|
---|
Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
Катеніни | |
---|
Мембранні | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Нелюдські | |
---|