SPTA1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1OWA, 3LBX | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SPTA1, EL2, HPP, HS3, SPH3, SPTA, Spectrin, alpha 1, spectrin alpha, erythrocytic 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 182860 MGI: 98385 HomoloGene: 74460 GeneCards: SPTA1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
hereditary spherocytosis type 3, hereditary pyropoikilocytosis[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • actin filament binding • structural constituent of cytoskeleton • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • protein heterodimerization activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • intrinsic component of the cytoplasmic side of the plasma membrane • cell cortex • actin cytoskeleton • цитоскелет • spectrin • spectrin-associated cytoskeleton • cytoplasmic side of plasma membrane • мембрана • аксон • cortical cytoskeleton • cuticular plate |
---|
Біологічний процес | • actin filament organization • MAPK cascade • axon guidance • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • actin filament capping • regulation of cell shape • lymphocyte homeostasis • porphyrin-containing compound biosynthetic process • plasma membrane organization • actin cytoskeleton organization • кровотворення • positive regulation of protein binding • positive regulation of T cell proliferation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 158.61 – 158.69 Mb | Хр. 1: 174 – 174.08 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SPTA1 (англ. Spectrin alpha, erythrocytic 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 419 амінокислот, а молекулярна маса — 280 014[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEQFPKETVV | | ESSGPKVLET | | AEEIQERRQE | | VLTRYQSFKE | | RVAERGQKLE |
DSYHLQVFKR | | DADDLGKWIM | | EKVNILTDKS | | YEDPTNIQGK | | YQKHQSLEAE |
VQTKSRLMSE | | LEKTREERFT | | MGHSAHEETK | | AHIEELRHLW | | DLLLELTLEK |
GDQLLRALKF | | QQYVQECADI | | LEWIGDKEAI | | ATSVELGEDW | | ERTEVLHKKF |
EDFQVELVAK | | EGRVVEVNQY | | ANECAEENHP | | DLPLIQSKQN | | EVNAAWERLR |
GLALQRQKAL | | SNAANLQRFK | | RDVTEAIQWI | | KEKEPVLTSE | | DYGKDLVASE |
GLFHSHKGLE | | RNLAVMSDKV | | KELCAKAEKL | | TLSHPSDAPQ | | IQEMKEDLVS |
SWEHIRALAT | | SRYEKLQATY | | WYHRFSSDFD | | ELSGWMNEKT | | AAINADELPT |
DVAGGEVLLD | | RHQQHKHEID | | SYDDRFQSAD | | ETGQDLVNAN | | HEASDEVREK |
MEILDNNWTA | | LLELWDERHR | | QYEQCLDFHL | | FYRDSEQVDS | | WMSRQEAFLE |
NEDLGNSLGS | | AEALLQKHED | | FEEAFTAQEE | | KIITVDKTAT | | KLIGDDHYDS |
ENIKAIRDGL | | LARRDALREK | | AATRRRLLKE | | SLLLQKLYED | | SDDLKNWINK |
KKKLADDEDY | | KDIQNLKSRV | | QKQQVFEKEL | | AVNKTQLENI | | QKTGQEMIEG |
GHYASDNVTT | | RLSEVASLWE | | ELLEATKQKG | | TQLHEANQQL | | QFENNAEDLQ |
RWLEDVEWQV | | TSEDYGKGLA | | EVQNRLRKHG | | LLESAVAARQ | | DQVDILTDLA |
AYFEEIGHPD | | SKDIRARQES | | LVCRFEALKE | | PLATRKKKLL | | DLLHLQLICR |
DTEDEEAWIQ | | ETEPSATSTY | | LGKDLIASKK | | LLNRHRVILE | | NIASHEPRIQ |
EITERGNKMV | | EEGHFAAEDV | | ASRVKSLNQN | | MESLRARAAR | | RQNDLEANVQ |
FQQYLADLHE | | AETWIREKEP | | IVDNTNYGAD | | EEAAGALLKK | | HEAFLLDLNS |
FGDSMKALRN | | QANACQQQQA | | APVEGVAGEQ | | RVMALYDFQA | | RSPREVTMKK |
GDVLTLLSSI | | NKDWWKVEAA | | DHQGIVPAVY | | VRRLAHDEFP | | MLPQRRREEP |
GNITQRQEQI | | ENQYRSLLDR | | AEERRRRLLQ | | RYNEFLLAYE | | AGDMLEWIQE |
KKAENTGVEL | | DDVWELQKKF | | DEFQKDLNTN | | EPRLRDINKV | | ADDLLFEGLL |
TPEGAQIRQE | | LNSRWGSLQR | | LADEQRQLLG | | SAHAVEVFHR | | EADDTKEQIE |
KKCQALSAAD | | PGSDLFSVQA | | LQRRHEGFER | | DLVPLGDKVT | | ILGETAERLS |
ESHPDATEDL | | QRQKMELNEA | | WEDLQGRTKD | | RKESLNEAQK | | FYLFLSKARD |
LQNWISSIGG | | MVSSQELAED | | LTGIEILLER | | HQEHRADMEA | | EAPTFQALED |
FSAELIDSGH | | HASPEIEKKL | | QAVKLERDDL | | EKAWEKRKKI | | LDQCLELQMF |
QGNCDQVESW | | MVARENSLRS | | DDKSSLDSLE | | ALMKKRDDLD | | KAITAQEGKI |
TDLEHFAESL | | IADEHYAKEE | | IATRLQRVLD | | RWKALKAQLI | | DERTKLGDYA |
NLKQFYRDLE | | ELEEWISEML | | PTACDESYKD | | ATNIQRKYLK | | HQTFAHEVDG |
RSEQVHGVIN | | LGNSLIECSA | | CDGNEEAMKE | | QLEQLKEHWD | | HLLERTNDKG |
KKLNEASRQQ | | RFNTSIRDFE | | FWLSEAETLL | | AMKDQARDLA | | SAGNLLKKHQ |
LLEREMLARE | | DALKDLNTLA | | EDLLSSGTFN | | VDQIVKKKDN | | VNKRFLNVQE |
LAAAHHEKLK | | EAYALFQFFQ | | DLDDEESWIE | | EKLIRVSSQD | | YGRDLQGVQN |
LLKKHKRLEG | | ELVAHEPAIQ | | NVLDMAEKLK | | DKAAVGQEEI | | QLRLAQFVEH |
WEKLKELAKA | | RGLKLEESLE | | YLQFMQNAEE | | EEAWINEKNA | | LAVRGDCGDT |
LAATQSLLMK | | HEALENDFAV | | HETRVQNVCA | | QGEDILNKVL | | QEESQNKEIS |
SKIEALNEKT | | PSLAKAIAAW | | KLQLEDDYAF | | QEFNWKADVV | | EAWIADKETS |
LKTNGNGADL | | GDFLTLLAKQ | | DTLDASLQSF | | QQERLPEITD | | LKDKLISAQH |
NQSKAIEERY | | AALLKRWEQL | | LEASAVHRQK | | LLEKQLPLQK | | AEDLFVEFAH |
KASALNNWCE | | KMEENLSEPV | | HCVSLNEIRQ | | LQKDHEDFLA | | SLARAQADFK |
CLLELDQQIK | | ALGVPSSPYT | | WLTVEVLERT | | WKHLSDIIEE | | REQELQKEEA |
RQVKNFEMCQ | | EFEQNASTFL | | QWILETRAYF | | LDGSLLKETG | | TLESQLEANK |
RKQKEIQAMK | | RQLTKIVDLG | | DNLEDALILD | | IKYSTIGLAQ | | QWDQLYQLGL |
RMQHNLEQQI | | QAKDIKGVSE | | ETLKEFSTIY | | KHFDENLTGR | | LTHKEFRSCL |
RGLNYYLPMV | | EEDEHEPKFE | | KFLDAVDPGR | | KGYVSLEDYT | | AFLIDKESEN |
IKSSDEIENA | | FQALAEGKSY | | ITKEDMKQAL | | TPEQVSFCAT | | HMQQYMDPRG |
RSHLSGYDYV | | GFTNSYFGN |
Кодований геном білок за функціями належить до кепінгів актину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пдтримання форми клітини, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- Linnenbach A.J., Speicher D.W., Marchesi V.T., Forget B.G. (1986). Cloning of a portion of the chromosomal gene for human erythrocyte alpha-spectrin by using a synthetic gene fragment. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 2397—2401. PMID 3458204 DOI:10.1073/pnas.83.8.2397
- Speicher D.W., Marchesi V.T. (1984). Erythrocyte spectrin is comprised of many homologous triple helical segments. Nature. 311: 177—180. PMID 6472478 DOI:10.1038/311177a0
- Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening. BMC Immunol. 10: 53—53. PMID 19807924 DOI:10.1186/1471-2172-10-53
- Park S., Caffrey M.S., Johnson M.E., Fung L.W.-M. (2003). Solution structural studies on human erythrocyte alpha-spectrin tetramerization site. J. Biol. Chem. 278: 21837—21844. PMID 12672815 DOI:10.1074/jbc.M300617200
- Maillet P., Alloisio N., Morle L., Delaunay J. (1996). Spectrin mutations in hereditary elliptocytosis and hereditary spherocytosis. Hum. Mutat. 8: 97—107. PMID 8844207 DOI:10.1002/(SICI)1098-1004(1996)8:2<97::AID-HUMU1>3.3.CO;2-W
- Speicher D.W., Davis G., Marchesi V.T. (1983). Structure of human erythrocyte spectrin. II. The sequence of the alpha-I domain. J. Biol. Chem. 258: 14938—14947. PMID 6654896
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SPTA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11272 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P02549 (англ.) . Архів оригіналу за 26 лютого 2018. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
Незгруповані альфа | |
---|
Не-альфа | |
---|
|
---|
Тип 3 | |
---|
Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
Тип 5 | |
---|
|
---|
Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
Катеніни | |
---|
Мембранні | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Нелюдські | |
---|