PKP3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PKP3, plakophilin 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605561 MGI: 1891830 HomoloGene: 5200 GeneCards: PKP3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • alpha-catenin binding • cell adhesion molecule binding • cadherin binding involved in cell-cell adhesion • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • translation regulator activity • cadherin binding |
---|
Клітинна компонента | • Десмосома • клітинне ядро • cell-cell junction • cornified envelope • нуклеоплазма • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • messenger ribonucleoprotein complex • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • desmosome assembly • адгезія клітин • keratinization • cornification • regulation of translation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of mRNA catabolic process • protein localization to plasma membrane • cell-cell adhesion • cell-cell junction assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 0.39 – 0.4 Mb | Хр. 7: 140.66 – 140.67 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PKP3 (англ. Plakophilin 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 797 амінокислот, а молекулярна маса — 87 082[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MQDGNFLLSA | | LQPEAGVCSL | | ALPSDLQLDR | | RGAEGPEAER | | LRAARVQEQV |
RARLLQLGQQ | | PRHNGAAEPE | | PEAETARGTS | | RGQYHTLQAG | | FSSRSQGLSG |
DKTSGFRPIA | | KPAYSPASWS | | SRSAVDLSCS | | RRLSSAHNGG | | SAFGAAGYGG |
AQPTPPMPTR | | PVSFHERGGV | | GSRADYDTLS | | LRSLRLGPGG | | LDDRYSLVSE |
QLEPAATSTY | | RAFAYERQAS | | SSSSRAGGLD | | WPEATEVSPS | | RTIRAPAVRT |
LQRFQSSHRS | | RGVGGAVPGA | | VLEPVARAPS | | VRSLSLSLAD | | SGHLPDVHGF |
NSYGSHRTLQ | | RLSSGFDDID | | LPSAVKYLMA | | SDPNLQVLGA | | AYIQHKCYSD |
AAAKKQARSL | | QAVPRLVKLF | | NHANQEVQRH | | ATGAMRNLIY | | DNADNKLALV |
EENGIFELLR | | TLREQDDELR | | KNVTGILWNL | | SSSDHLKDRL | | ARDTLEQLTD |
LVLSPLSGAG | | GPPLIQQNAS | | EAEIFYNATG | | FLRNLSSASQ | | ATRQKMRECH |
GLVDALVTSI | | NHALDAGKCE | | DKSVENAVCV | | LRNLSYRLYD | | EMPPSALQRL |
EGRGRRDLAG | | APPGEVVGCF | | TPQSRRLREL | | PLAADALTFA | | EVSKDPKGLE |
WLWSPQIVGL | | YNRLLQRCEL | | NRHTTEAAAG | | ALQNITAGDR | | RWAGVLSRLA |
LEQERILNPL | | LDRVRTADHH | | QLRSLTGLIR | | NLSRNARNKD | | EMSTKVVSHL |
IEKLPGSVGE | | KSPPAEVLVN | | IIAVLNNLVV | | ASPIAARDLL | | YFDGLRKLIF |
IKKKRDSPDS | | EKSSRAASSL | | LANLWQYNKL | | HRDFRAKGYR | | KEDFLGP |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Локалізований у ядрі, клітинних контактах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Bonne S., van Hengel J., Nollet F., Kools P., van Roy F. (1999). Plakophilin-3, a novel armadillo-like protein present in nuclei and desmosomes of epithelial cells. J. Cell Sci. 112: 2265—2276. PMID 10381383
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9025 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9Y446 (англ.) . Архів оригіналу за 20 жовтня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
Незгруповані альфа | |
---|
Не-альфа | |
---|
|
---|
Тип 3 | |
---|
Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
Тип 5 | |
---|
|
---|
Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
Катеніни | |
---|
Мембранні | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Нелюдські | |
---|