TMOD1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4PKG, 4PKH, 4PKI, 4Z8G, 4Z94 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TMOD1, D9S57E, ETMOD, TMOD, tropomodulin 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 190930 MGI: 98775 HomoloGene: 20701 GeneCards: TMOD1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ожиріння[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • actin filament binding • actin binding • tropomyosin binding |
---|
Клітинна компонента | • мембрана • COP9 signalosome • цитоскелет • гіалоплазма • cortical cytoskeleton • цитоплазма • саркомера • міофібрила • мікрофіламент • striated muscle thin filament |
---|
Біологічний процес | • adult locomotory behavior • lens fiber cell development • muscle filament sliding • pointed-end actin filament capping • м'язове скорочення • actin filament organization • myofibril assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | н/д | Хр. 4: 46.04 – 46.12 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TMOD1 (англ. Tropomodulin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 359 амінокислот, а молекулярна маса — 40 569[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSYRRELEKY | | RDLDEDEILG | | ALTEEELRTL | | ENELDELDPD | | NALLPAGLRQ |
KDQTTKAPTG | | PFKREELLDH | | LEKQAKEFKD | | REDLVPYTGE | | KRGKVWVPKQ |
KPLDPVLESV | | TLEPELEEAL | | ANASDAELCD | | IAAILGMHTL | | MSNQQYYQAL |
SSSSIMNKEG | | LNSVIKPTQY | | KPVPDEEPNS | | TDVEETLERI | | KNNDPKLEEV |
NLNNIRNIPI | | PTLKAYAEAL | | KENSYVKKFS | | IVGTRSNDPV | | AYALAEMLKE |
NKVLKTLNVE | | SNFISGAGIL | | RLVEALPYNT | | SLVEMKIDNQ | | SQPLGNKVEM |
EIVSMLEKNA | | TLLKFGYHFT | | QQGPRLRASN | | AMMNNNDLVR | | KRRLADLTGP |
IIPKCRSGV |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- Chu X., Thompson D., Yee L.J., Sung L.A. (2000). Genomic organization of mouse and human erythrocyte tropomodulin genes encoding the pointed end capping protein for the actin filaments. Gene. 256: 271—281. PMID 11054557 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00327-9
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Sung L.A., Lin J.J.-C. (1994). Erythrocyte tropomodulin binds to the N-terminus of hTM5, a tropomyosin isoform encoded by the gamma-tropomyosin gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 201: 627—634. PMID 8002995 DOI:10.1006/bbrc.1994.1747
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TMOD1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11871 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P28289 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
Незгруповані альфа | |
---|
Не-альфа | |
---|
|
---|
Тип 3 | |
---|
Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
Тип 5 | |
---|
|
---|
Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
Катеніни | |
---|
Мембранні | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Нелюдські | |
---|