KIF1B |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | KIF1B, CMT2, CMT2A, CMT2A1, HMSNII, KLP, NBLST1, kinesin family member 1B |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605995 MGI: 108426 HomoloGene: 99835 GeneCards: KIF1B |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
розсіяний склероз, феохромоцитома[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • microtubule motor activity • nucleotide binding • microtubule binding • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • kinesin binding • ATP binding • kinase binding • scaffold protein binding • plus-end-directed microtubule motor activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • Кінезин • microtubule associated complex • мітохондрія • neuron projection • мікротрубочка • цитоскелет • cytoplasmic vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • axon cytoplasm • мембрана • аксон • дендрит (нейробіологія) |
---|
Біологічний процес | • cytoskeleton-dependent intracellular transport • neuron-neuron synaptic transmission • anterograde axonal transport • microtubule-based movement • neuromuscular synaptic transmission • mitochondrion transport along microtubule • GO:0097285 апоптоз • GO:1901313 positive regulation of gene expression • transport along microtubule • lysosome localization • response to rotenone • cellular response to nerve growth factor stimulus • protein localization to cell periphery • anterograde neuronal dense core vesicle transport • retrograde neuronal dense core vesicle transport • vesicle-mediated transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_183416 NM_015074 NM_001365951 NM_001365952 NM_001365953 |
| | NM_001290995 NM_008441 NM_207682 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_055889 NP_904325 NP_001352880 NP_001352881 NP_001352882 |
| | NP_001277924 NP_032467 NP_997565 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 10.21 – 10.38 Mb | Хр. 4: 149.26 – 149.39 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
KIF1B (англ. Kinesin family member 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 816 амінокислот, а молекулярна маса — 204 476[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSGASVKVAV | | RVRPFNSRET | | SKESKCIIQM | | QGNSTSIINP | | KNPKEAPKSF |
SFDYSYWSHT | | SPEDPCFASQ | | NRVYNDIGKE | | MLLHAFEGYN | | VCIFAYGQTG |
AGKSYTMMGK | | QEESQAGIIP | | QLCEELFEKI | | NDNCNEEMSY | | SVEVSYMEIY |
CERVRDLLNP | | KNKGNLRVRE | | HPLLGPYVED | | LSKLAVTSYT | | DIADLMDAGN |
KARTVAATNM | | NETSSRSHAV | | FTIVFTQKKH | | DNETNLSTEK | | VSKISLVDLA |
GSERADSTGA | | KGTRLKEGAN | | INKSLTTLGK | | VISALAEVDN | | CTSKSKKKKK |
TDFIPYRDSV | | LTWLLRENLG | | GNSRTAMVAA | | LSPADINYDE | | TLSTLRYADR |
AKQIKCNAVI | | NEDPNAKLVR | | ELKEEVTRLK | | DLLRAQGLGD | | IIDIDPLIDD |
YSGSGSKYLK | | DFQNNKHRYL | | LASENQRPGH | | FSTASMGSLT | | SSPSSCSLSS |
QVGLTSVTSI | | QERIMSTPGG | | EEAIERLKES | | EKIIAELNET | | WEEKLRKTEA |
IRMEREALLA | | EMGVAIREDG | | GTLGVFSPKK | | TPHLVNLNED | | PLMSECLLYY |
IKDGITRVGQ | | ADAERRQDIV | | LSGAHIKEEH | | CIFRSERSNS | | GEVIVTLEPC |
ERSETYVNGK | | RVSQPVQLRS | | GNRIIMGKNH | | VFRFNHPEQA | | RAEREKTPSA |
ETPSEPVDWT | | FAQRELLEKQ | | GIDMKQEMEK | | RLQEMEILYK | | KEKEEADLLL |
EQQRLDYESK | | LQALQKQVET | | RSLAAETTEE | | EEEEEEVPWT | | QHEFELAQWA |
FRKWKSHQFT | | SLRDLLWGNA | | VYLKEANAIS | | VELKKKVQFQ | | FVLLTDTLYS |
PLPPELLPTE | | MEKTHEDRPF | | PRTVVAVEVQ | | DLKNGATHYW | | SLEKLKQRLD |
LMREMYDRAG | | EMASSAQDES | | ETTVTGSDPF | | YDRFHWFKLV | | GSSPIFHGCV |
NERLADRTPS | | PTFSTADSDI | | TELADEQQDE | | MEDFDDEAFV | | DDAGSDAGTE |
EGSDLFSDGH | | DPFYDRSPWF | | ILVGRAFVYL | | SNLLYPVPLI | | HRVAIVSEKG |
EVRGFLRVAV | | QAIAADEEAP | | DYGSGIRQSG | | TAKISFDNEY | | FNQSDFSSVA |
MTRSGLSLEE | | LRIVEGQGQS | | SEVITPPEEI | | SRINDLDLKS | | STLLDGKMVM |
EGFSEEIGNH | | LKLGSAFTFR | | VTVLQASGIL | | PEYADIFCQF | | NFLHRHDEAF |
STEPLKNNGR | | GSPLAFYHVQ | | NIAVEITESF | | VDYIKTKPIV | | FEVFGHYQQH |
PLHLQGQELN | | SPPQPCRRFF | | PPPMPLSKPV | | PATKLNTMSK | | TSLGQSMSKY |
DLLVWFEISE | | LEPTGEYIPA | | VVDHTAGLPC | | QGTFLLHQGI | | QRRITVTIIH |
EKGSELHWKD | | VRELVVGRIR | | NKPEVDEAAV | | DAILSLNIIS | | AKYLKSSHNS |
SRTFYRFEAV | | WDSSLHNSLL | | LNRVTPYGEK | | IYMTLSAYLE | | LDHCIQPAVI |
TKDVCMVFYS | | RDAKISPPRS | | LRSLFGSGYS | | KSPDSNRVTG | | IYELSLCKMS |
DTGSPGMQRR | | RRKILDTSVA | | YVRGEENLAG | | WRPRGDSLIL | | EHQWELEKLE |
LLHEVEKTRH | | FLLLRERLGD | | SIPKSLSDSL | | SPSLSSGTLS | | TSTSISSQIS |
TTTFESAITP | | SESSGYDSGD | | IESLVDREKE | | LATKCLQLLT | | HTFNREFSQV |
HGSVSDCKLS | | DISPIGRDPS | | ESSFSSATLT | | PSSTCPSLVD | | SRSNSLDQKT |
PEANSRASSP | | CPEFEQFQIV | | PAVETPYLAR | | AGKNEFLNLV | | PDIEEIRPSS |
VVSKKGYLHF | | KEPLYSNWAK | | HFVVVRRPYV | | FIYNSDKDPV | | ERGIINLSTA |
QVEYSEDQQA | | MVKTPNTFAV | | CTKHRGVLLQ | | ALNDKDMNDW | | LYAFNPLLAG |
TIRSKLSRRC | | PSQSKY |
Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мітохондрії, цитоплазматичних везикулах.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Wozniak M.J., Melzer M., Dorner C., Haring H.U., Lammers R. (2005). The novel protein KBP regulates mitochondria localization by interaction with a kinesin-like protein. BMC Cell Biol. 6: 35—35. PMID 16225668 DOI:10.1186/1471-2121-6-35
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з KIF1B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16636 (англ.) . Архів оригіналу за 4 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O60333 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
Незгруповані альфа | |
---|
Не-альфа | |
---|
|
---|
Тип 3 | |
---|
Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
Тип 5 | |
---|
|
---|
Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
Катеніни | |
---|
Мембранні | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Нелюдські | |
---|